Tải bản đầy đủ (.pdf) (14 trang)

NHÂN DÒNG, ĐỌC TRÌNH TỰ VÀ BIỂU HIỆN TRONG P.pastoris MỘT cDNA XYLANASE MỚI VỪA ĐƯỢC PHÂN LẬP TỪ

Bạn đang xem bản rút gọn của tài liệu. Xem và tải ngay bản đầy đủ của tài liệu tại đây (364.68 KB, 14 trang )

ho c
NHÂN DỊNG,
C TRÌNH T VÀ BI U HI N TRONG P.pastoris
M T cDNA XYLANASE M I V A
C PHÂN L P T
A.awamori
1
2
Yinan Yang , Kuixian Shan , Lifeng Ping3 và Jingmei Lu3

i H c ông B c, Tr ng Xuân, Trung Qu c.
i H c Nông Nghi p Cát Lâm, Tr ng Xuân, Trung Qu c.
Vi n Tiêu Chu n và Ch t L ng Nông S n, Vi n Khoa H c Nông Nghi p Chi t
Giang , Hàng Châu, Trung Qu c.

Ch ng SH-2016 có th sinh ra xylanase đ c phân l p và nh n ra là
Aspergillus awamoris D a vào đ c đi m sinh lý và hóa sinh c a chúng c ng
nh k t qu phân tích trình t gen ITS rDNA. T ch ng A. awamori m i
phân l p này nhân dịng gen xylanase có kích th c 591bp và trình t ORF
(open reading frame) đ c d đốn mã hóa cho m t protein có 196 axit
amin v i tr ng l ng kho ng 21kDa. M t plasmid bi u hi n mang gen d i
s ki m soát c a methanol đ c đi u khi n b i m t promotor đi u khi n gen
oxidase r u (AOX1) đã đ c đ a vào P.pastoris và gen xylanase đã đ c
bi u hi n thành công trong môi tr ng s d ng methanol nh là ch t c m
ng. Xylanase đã đ c tinh s ch s d ng c t NI2+-NTA. Các đ c đi m c a
xylanase ting s ch đã đ c kh o sát.
T khóa: Aspergillus awamori, cDNA, nhân dòng, xylanase, bi u hi n
sinh v t nhân chu n, purification and characterization (tinh s ch và phân
tích)
M
U


Xylanase là các glycosidases, xúc tác cho ph n ng n i th y phân liên
k t 1,4- -D-xylosidic trong xylan. Xylanase có ngu n g c t n m, vi khu n
đã thu hút đ c nhi u s chú ý trong nh ng n m g n đây do ti m n ng công
ngh sinh h c c a chúng trong nhi u q trình cơng nghi p khác nhau.
Chúng đ c s n xu t trên qui mô công nghi p ng d ng đ t y tr ng gi y và
công nghi p t y tr ng b t gi y (Polizeli et al.,2005). Cùng v i glucanase,
pectinase, protease, amylase, phytase, Lypase, Glucanase c ng đ c s d ng
r ng rãi làm bi n tính anarabinoxylans trong thành ph n c a th c n, kh đ
nh t c a nguyên li u thô và c i bi n ch t dinh d ng (Silversides et al.,
2006). Trong công nghi p th c ph m, chúng đ c s d ng nh nh ng ph
gia trong b t bánh mì cho vi c c i bi n b t nhão t o đi u ki n thu n l i và
làm t ng ch t l ng s n ph m n ng. trong nghi p lên men, s thêm
xylanase t bên ngồi trong q trình nghi n đã có nh h ng quan tr ng
đ n gi i quy t các v n đ v arabinoxylans nh là đ nh t c a cây c , màng
đ m và đã làm gi m t l l c (Lu et al 2005).
S n xu t xylanase trên quy mô công nghi p d a trên t ng h p sinh
h c nh vi sinh v t. N m s i đã ch ng t là có m t kh n ng l n ti t ra m t


ho c
l ng ng u nhiên xylanase, v i các ch ng Aspergillus (Shah and
Madamwar, 2005), Penicillium (Li et al., 2007a, 2007b) Tricodema (Azin et
al 2007) h u h t đã đ c nghiên c u r ng rãi và đ c ki m tra l i kh n ng
sinh t ng h p xylanase. Có hai mơi tr ng cho nuôi c y ch ng vi sinh v t
sinh xylanase: ni c y chìm và ni c y trên môi tr ng r n. hi n nay,
80%-90% xylanase th ng ph m đ c s n xu t b ng ni c y chìm b i vì
chúng có kh n ng t ng c ng bi u hi n cao h n và m c đ t đ ng hóa cao
h n (Polizeli et al., 2005). Nhi u gen xylanase đã đ c nhân dòng và bi u
hi n trong E.coli ho c P.pastoris: m t s xylanase tái t h p đã đ c kh o
sát và ng d ng r ng rãi.

đáp ng nh ng ng d ng r ng rãi và nh ng nhu
c u đ c bi t c a th ng tr ng nhi u ch ng m i có th s n xu t ra xylanase
đang đ c tìm ki m ho c nhân dòng và bi u hi n gen xylanase v i nh ng
đ c đi m m i tr thành nh ng h ng đi nóng trong nh ng nghiên c u v
xylanase (Hessing et al., 1994; Polizeli et al., 2005).
Trong bài báo này trình bày m t gen m i mã hóa cho xylanase m i
đ c phân l p t A.awamoris và đã đ c nhân dịng và bi u hi n trong
P.pastoris X33. Sau đó t i u nhi t đ và pH và n đ nh nhi t đ tinh s ch
xylanase đã đ c xác đ nh đ nghiên c u kh n ng ng d ng trong công
nghi p c a chúng.
NGUYÊN LI U VÀ PH
NG PHÁP
CH NG GI NG VÀ NUÔI C Y
Aspergillus sp SH-2016 đã đ c ch n l c t nh ng ch ng thu th p t
các đ a ph ng. Môi tr ng nuôi c y g m có: NH4Cl, 9 gl -1;K2SO4,1 gl -1;
Na2NO3,1 gl -1;MgSO4.7H2O; CaCl2.2H2O 0,3 gl -1;yeast extract,1 gl -1. pH
ban đ u đ c đi u ch nh đ n 8. cho 50 ml mơi tr ng vào bình tam giác
(lo i 250ml) đ c v i 1ml (1x106 bào t /ml) d ch huy n phù đ c chu n
b t m t ng th ch nghiêng Aspergillus sp SH-2016 ni 30°C l c 150
vịng/phút.
E.coli JM109 đã đ c s d ng nh t bào ch đ bi n n p vector
plasmid pMD18-T-xynA và pPICZaA-xynA. E.coli bi n n p đ c nuôi
trong môi tr ng LB l ng (Luria-Bertani). P.pastoris đ c s d ng nh t
bào ch cho s bi u hi n c a pPICZaA-xynA. P.pastoris X33 đã đ c bi n
n p đ c nuôi trên môi tr ng (YPDS) ch n l c r n: cao n m men (1%
v/vv), pepton 2%(w/v) dextrose (D-glucose, 2% w/v), Sorbitol 1%(w/v) và
Zeocin (100 mg ml-1).
Môi tr ng BMGGY. [5g cao n m men, 10 g peptone, 50ml KPO4
1M đ m pH=6.0, 1,7g bazo nito n m men, 5g amoni sulsunfat (NH4)2SO4,
5ml glyxerol đ c kh trùng 121°C trong 30 phút và làm l nh xu ng đ n

nhi t đ phịng, thêm vào mơi tr ng Biotin (500x1ml) và Histidine


ho c
(96x5,2ml)] đ c s d ng đ nuôi c y P.pastoris tái t h p ch a xylanase.
Môi tr ng BMMY [5g cao n m men, 10g peptone, 50ml KPO4 1M đ m
pH6.0, 1,7g base nit n m men và 5g amoni sunfat (NH3)2SO4 đ c h p kh
trùng 121°C trong 30 phút, và đ ngu i xu ng đ n nhi t đ phịng thêm
vào mơi tr ng 2,4ml methanol, Biotin (500x1ml) và Histidin (96x5,2ml)
đ c s d ng cho c m ng và bi u hi n xylanase P.pastoris.
PHÂN L P CH NG S N XU T XYLANASE
Các ch ng khác nhau bao g m Aspergillus sp. SH-2016 đ c phân
l p t các m u đ t, ph ng th c phân l p chi ti t th c hi n theo ph ng
pháp đã đ c Abrusci mô t (Abrusci et al 2005).
XÁC

NH CH NG Aspergillus sp, SH-2016

Xác đ nh ch ng d a vào phân tích đ c đi m hình thái chu n, phân tích
trình t nucleotide ITS rDNA mã hóa cho enzyme đã đ c khuy ch đ i, và
vùng ITS (internal transcribed spacer) bao g m 5.8 S rDNA. Phân tích đ c
đi m hình thái c a ch ng nuôi c y b ng quan sát trên cùng m t kính hi n vi
quang h c và trên cùng m t kính hi n vi đi n t qt. Phân tích trình t ,
DNA nhi m s c th đ c phân l p theo ph ng pháp Doyle(1987). S
khuy ch đ i đã đ c th c hi n v i m i thi t k pITS1 (5’TCCGTAGGTGAACCTGCCG-3’)

pITS4
(5’TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’) trong máy chu trình nhi t (máy PCR)
(Bio-Rad, USA) d i đi u ki n cho phép: 95°C, 3 phút; 35 chu k 95°C, 30
giây; 53°C, 30 giây; 72°C, 2 phút và cu i cùng gi 10 phút 72°C. M i

ph n ng PCR l y 5µl s n ph m đem ki m tra b ng đi n di trên gel agarose
1%
70V trong 2 gi .
m TAE [0,4 M tris; 50mM NaOAc
(natrioxaloaxetac); 10mM EDTA; pH=7,8] và đ c quan sát tia UV sau khi
đã nhu m ethidiumbromide (0,5µg/ml). s n ph m PCR đ c n i v i vector
pMD18-T (Takara-Nh t B n) theo ph ng pháp Liu và Sun (2004). Vector
thi t k đã đ c chuy n vào t bào E.coli kh bi n theo ph ng pháp Chung
(Chung et al., 1989). Sau đó c y tr i trên mơi tr ng LB có ch a Xgal (5bromo-4-chloro-3-indolyl- -D-galactosidase), IPTG (isopropyl-1-thio- -Dgalactoside) và ampicillin (50µg/ml). ti p theo, ch ng mà đã chuy n thành
công đ c g i là E.coli JM109/pMD18-T-ITS. DNA ITS đã đ c đ c trình
t b ng c hai b kits [
Trình t nh n đ c đã kh o sát và so sánh v i các trình t trong c s d
li u ngân hàng gen (Genbanks) s d ng ch ng trình BLAST. Phân tích
trình t đ c th c hi n nh s d ng các ch ng trình SEQBOOT,


ho c
NEIGHBOR-JOIN và DNASENSE c a Philips (phiên b n 3.572) sau đó
đ c s d ng đ thành l p cây quan h di truy n. Xác minh h th ng d li u
Microseq và so sánh v i các trình t khác th ng đ c s d ng trong các h
th ng DDJB/EMBL/GenBank.
CHU N B RNA T NG S C A Aspergillus sp. SH-2016
Các t bào thu nh n đ c thông qua l c, đ c r a hai l n v i đ m
mu i phosphate (PBS, 137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 4.3 mM
Na2HPO4.7H2O, 1.4 mM KH2PO4 pH=7.3) Sau đó, làm l nh trong nit l ng,
ground và chuy n vào m t ng nghi m s ch ch a đ m ly gi i (6 M
guanidinium hydrochloride, 37.7 M axit xitric, 0.75 M N-lauroyl sarcosine
sodium, 0.15 M -sulfhydryl ethanol), và acid guanidium phenol chlorofol
theo ph ng pháp c a Chomozynsky và Sachi (1987) đã đ c s d ng đ
phân l p RNA t ng s t Aspergillus sp.SH-2016. poly (A+) RNA đã đ c

ch n l c t RNA t ng s b ng cách s d ng oligo-dT30 (Promega,
Madison, USA).
T NG H P cDNA và KHU CH

I PCR

M ch cDNA đ u tiên đ c t ng h p nh RT-PCR v i olio(dT)15 s
d ng mRNA đ c phân l p t Aspergillus sp.SH-2016 theo manufacture’s
procol (Clontech, mountain view, CA, USA). cDNA c a Aspergillus sp.SH2016 mã hóa cho xylanase đã đ c khu ch đ i nh đ u 3’ race(Rapid
application of cDNA ends) v i m i 5’-GCTCCTGTGCCGGAACCTG-3’ và
oligo(dT)15 đã đ c thi t k d a trên trình t c a đ u t n cùng –NH2 và
cDNA mã hóa cho xylanase đã đ c công b trên ngân hàng gen qu c t
(NCBI). Và c u trúc c a mRNA và m ch cDNA th nh t đ u l n l t đ c
s d ng nh m ch khuân. PCR đã đ c th c hi n trong 50µl s d ng máy
chu trình nhi t (Bio-Rad, Hercules, CA, USA). S n ph m PCR đã đ c quan
sát trên gel sau khi đã nhu m ethidium bromide 1.5%. k t qu là các đo n
DNA đ c n i v i pMD18-T(takaru, Otsu, Shiga, Nh t B n) nh s d ng
ph ng pháp nhân dòng T/A. vector đã thi t k đ c chuy n vào t bào
E.coli kh bi n theo ph ng pháp c a Chung (Chung et al.,1989) và sau đó
c y tr i trên mơi tr ng LB có ch a X-gal, IPTG và ampicillin (50µgml -1).
Tieepstheo, các ch ng d ng tính, đ c nh n ra là E.coli JM109/pMD18-TxynA đã đ c thu nh n. DNA đã đ c đ c trình t . Trình t đã đ c thu
nh n đ c phân tích nh s d ng ph n m n DNAMEN (b n 4.0 Lynnon,
Biosoft, CANADA) sau đó đ c kh o sát và so sánh v i các trình t trong
c s d li u c a ngân hàng gen s d ng ch ng trình BLAST.


ho c
THI T K
XYLANASE


VECTOR BI U HI N C A cDNA MÃ HÓA CHO

guanidinium hydrochloride o n ORF c a xylanase đ c thu nh n nh s
d ng DNA polymerase ch u nhi t (Takara, Otsu, Shiga, Nh t B n) v i s có
m t c a các m i 5’ATTGAATTCGCACCTGTTCCTGAGCCTG-3’ (có v
trí
nh n
bi t
c a
E.coR
I)

5’GGTCTCGAGTGATGAAATTGTAACGGAG-3’(có v trí nh n bi t c a
Xhol) đ c thi t k theo trình t c a vector pMD18-T-xynA. S n ph m
PCR và vector pPICZaA (Novogen, New Canaan, CT, USA) đã đ c s lý
v i enzyme gi i h n E.coR I và Xhol, và thu h i l i nh đi n di trên gel
agarose sau đó đ c n i l i nh T4-DNA ligase. Plasmid pPICZaA đã n i
đ c bi n n p vào E.coli JM109.ch n l c nh ng khu n l c đ n và chuy n
sang môi tr ng LB l ng(3ml) v i 100µg ampicillin và qua đêm 37°C
l c m nh 200 vịng/phút. Gi ng ni c y đ c s d ng đ tách plasmid
trong môi tr ng ki m y u (Sambrock et al.,2001). Plasmid đã đ c s lý
v i E.coR I và Xhol v i m c đích nh n bi t các plamid tái t h p đã đ c
tái t h p thành cơng. Sau đó m t plasmid mang đo n gen cDNA
(pPICZaA-xynA) đ c thu đ c, plasmid đã tái t h p đ c t o dòng và
chuy n vào P.pastoris X33 nh t o l b ng đi n (electroporation), ch ng đã
bi n n p đ c ch n l c trên môi tr ng YPDS.
THAO TÁC DNA và BI N N P
Thao tác DNA, phân l p plasmid, và đi n di trên gel agarose đ
th c hi n theo Sambrock (Sambrock et al.,2001). Bi n n p vào E.coli đ
th c hi n theo Chung (Chung et al.,1989).


c
c

TINH S CH và BI U HI N PROTEIN
T t c các b c tinh s ch đ c th c hi n 4°C . Môi các khu n l c
đ n đ c ch n l a chuy n vào 5ml BMGY tr c khi nuôi c y, và đ c
qua đêm 30°C. Sau đó, ly tâm 6000 vòng trong 10 phút. Các t bào đ c
chuy n vào môi tr ng BMMY 25ml v a cho c m ng và bi u hi n (for 3
d) thêm vào mơi tr ng 250µl methanol, 3 l n m t ngày. Sau khi bi u hi n,
d ch lên men l ng đ c ly tâm 8000 vịng/10 phút 4°C. Ph n d ch n i có
ch a protein xylanase thô đ c chuy n vào c t NI2+-NTA. Ph ng pháp
r a và thôi c t đ c th c hi n theo h ng d n c a nhà s n xu t. Protein đã
tinh s ch đ c b o qu n -80°C tr c khi đi n di SDS-PAGE và phân tích
các đ c đi m hóa sinh. N ng đ protein đ c th c hi n theo ph ng pháp
Bradford (Bradford, 1976) s d ng abumin huy t thanh bò làm chu n.


ho c
CÁC PHÂN TÍCH HO H

XYLANASE

Ho t đ xylanase đ c xác đ nh b ng cách đo l ng đ ng kh đ c
gi i phóng t th y phân xylan lúa mì, y n m ch (1% w/v) s d ng ph ng
pháp axit dinitrosalisilic (Miller,1959). H n h p ph n ng g m có 1ml dung
d ch hịa tan xylan lúa mì y n m ch 1% trong đ m nitrate 50mM, pH=5
thêm vào 1ml enzyme tinh s ch d ng l ng;
50°C trong 30 phút. M t
đ n v xylanase đ c đ nh ngh a là l ng enzyme c n thi t đ phân gi i

1µmol xylose t xylan trong vịng m t phút d i đi u ki n phòng thí
nghi m.
NG KÝ TRÌNH T
Trình t nucleotide đ
EU846238 và EU846238.

c đ ng ký trên ngân hàng gen v i mã s

K T QU
NH N BI T CH NG Aspergillus sp.SH-2016 SINH XYLANASE
Nh n bi t ch ng Aspergillus sp.SH-2016 trên c s phân tích chi ti t
các đ c đi m hình thái sinh lý và trình t gen ITS rDNA (gen có mã s đ ng
ký trên ngân hàng: EU846237). K t qu phân tích đã ch ra r ng ch ng này
gi ng v i ch ng A.awamori (t ng đ ng, 99%/582bps, d a trên ITS rDNA.
///theo phân tích các đ c đi m hình thái sinh lý c ng nh so sánh trình t gen
ITS rDNA th y r ng ch ng Asperrgillus sp.SH-2016 r t gi ng v i ch ng
Aspergillus awamori nên đ t tên là Aspergillus awamori SH-2016.
RT-PCR và KHU CH

I cDNA

S n
ph m
đ c
khu ch
đ i
v i
m i
5’GCTCCTGTGCCGGAACCTG-3’ và oligo(dT)15 đ c dùng đi n di trên
gel agarose. Các đo n này đ c khôi ph c và n i v i plasmid pMD18-TxynA và đ c chuy n vào t bào E.coli JM109 kh bi n. m t s dòng d ng

tính (khu n l c khơng màu) đã đ c thu nh n. ba dịng trong s đó đã đ c
thu nh n đ chu n b m ch đ n cho đ c trình t . K t qu thu đ c m t trình
t kho n 1.6 kb. Phân tích trình t s d ng ph n m n DNAMEN (phiên b n
4.0, Lynnon Biosoft, CANADA) đã ch ra r ng đo n đ c khu ch đ i ch a
m t khung đ c m đ y đ g m 591bp mã hóa cho 196 axit amin. So sánh
trình t t ng đ ng th y r ng trình t này gi ng v i m t s gen xylanase đã
đ c công b (X78115,D14848). Aligment result also suggested that the
part or cDNA not containing the upstream sequence has been obtained. Tuy


ho c
nhiên v m t khách quan đã nhân dòng đ c gen cDNA c u trúc mã hóa cho
xylanase. Ph ng pháp này d dàng h n và r ti n h n là thi t k th vi n
cDNA. Ti p theo, c p m i v i đi m nh n bi t c a E.coR I và Xhol l n l t
đ c thi t k và khu ch đ i PCR đã đ c đi u khi n đ ch n l a vector tái
t h p pMD18-T-xynA và k t qu là, s n ph m PCR đã đ c dùng cho gel
agarose và đ c đ c trình t .
S

BI U HI N và TINH S CH XYLANASE

R t nhi u protein c n ph i hình thành các c u n i disulfide n đ nh đ
các n p g p t o thành d ng nguyên th . N u khơng có s hình thành các c u
n i disulfide n đ nh, nh ng protein này có b đào th i ho c tích l y nh
nh ng th n nh p (th vùi). ó là đi u không d dàng bi u hi n gen c a
sinh v t nhân chu n trong t bào sinh v t nhân s . Th m chí n u gen này có
th bi u hi n thì các s n ph m này th ng khơng hịa tan và khơng thành
d ng ho t đ ng trong môi tr ng n i bào.
t o đi u ki n thu n l i cho s
bi u hi n c a xylanase trong các t bào ch không đ ng nh t (t bào có

ngu n g c khác nhau) chúng tơi đã bi u hi n xylanase này trong P.pastoris.
ng th i, pPICZaA vector v i trình t tín hi u là nhân t
đã đ c s
d ng cho s bi u hi n. Các s n ph m đ c bi u hi n trong t bào ch có th
đ c v n chuy n ra môi tr ng và trình t tín hi u c t nh h th ng nh n
bi t tín hi u c a t bào ch sau đó s n ph m đ c bi u hi n sau khi protein
tái t o l i các n p g p thành d ng ho t đ ng. C u trúc c a gen xylanase
(đ c đ ng ký trên ngân hàng gen v i mã s : EU846238) đã đ c x lý v i
enzyme gi i h n đ c nhân dòng s d ng vector bi u hi n pPICZaA. B n
đ plasmid tái t h p đ c ch ra trong hình 4. sau đó, plasmid này đ c
chuy n vào các t bào E.coli JM109 kh bi n và đ c nhân dịng. Sau khi ly
trích, plasmid tái t h p ch a đ ng c u trúc gen mã hóa xylanase đã đ c
nhân dịng. K t qu đ c trình t plasmid tái t h p đã ch ra r ng gen đích đã
đ c thu nh n.cu i cùng plasmid pPICZaA-T-xynA đã đ c t o dòng nh
Sac I và đ c chuy n vào P.pastoris X33 và m t s ch ng bi n n p thành
công đã đ c thu nh n trên môi tr ng ch n l c nh ng khu n l c đ n đ c
chuy n sang môi tr ng BMMY sau đó kho ng 24 gi r i thu nh n t bào
nh ly tâm 6000 vòng trong 5 phút. Các t bào đ c tái sinh l l ng trong
môi tr ng BMGY và đ c c m ng b i 250µl methanol thêm vào ba l n
trên m t ngày. Sau c m ng, ta thu d ch n i nh ly tâm 6000 vòng và ho t
đ c a enzyme đã đ c xác đ nh. Kêt qu ch ra trong b ng 1. K t qu này
ch ra r ng ho t tính c a xylanase đã đ c bi u hi n thành công trong nghiên
c u này. Sau khi bi u hi n xylanase đã đ c tinh s ch s d ng c t NI2+NTA. Enzyme đã đ c gi
4°C trong glycerol 20 % trong vài tu n. đi n di


ho c
SDS-PAGE enzyme tinh s ch đã thu đ
21kDa.
NH H


c m t b ng có kích th

cx px

NG C A pH T I HO T TÍNH C A XYLANASE

Các ph n gi ng nhau c a enzyme tinh s ch đ
đ m khác nhau

c hòa tan trong các

Sau đó đo ho t đ t ng đ i cịn l i đ đánh giá s nh h ng c a pH trong
các đi u ki n thí nghi m chu n. Trong thí nghi m này đ m g m có axit
xitric NaHPO (pH 3.4-8.0) và Tris-HCl (pH=7.2-9.1) v i n ng đ 100mM
s d ng cho m i l n. sau khi v i các đ m pH khác nhau đã khám phá ra
r ng xylanase th hi n trong kho ng pH=3-8 nh ng th hi n ho t tính cao
nh t pH=4. K t qu chi ti t hình 6.


ho c
NH H

NG C A NHI T

T I HO T TÍNH C A XYLANASE

ánh giá nh h ng c a nhi t đ lên ho t tính c a enzyme, enzyme
đã đ c s lý tr c các nhi t đ khác nhau t 20-85°C. Ho t tính d (còn
l i) t ng đ i đã đ c xác đ nh trong các đi u ki n chu n phịng thí nghi m.

Ho t tính c a enzyme mà đã th nghi m d i các đi u ki n ph n ng g n
nh là 100%. Ho t tính c a enzyme gi m ch m t 20-60°C, gi m m nh
70°C, và g n nh m t ho t tính 85°C. nh v y enzyme này đã nh y c m
v i nhi t đ . Chi ti t xem hình 7.
NH H NG C A ION KIM LO I VÀ CÁC TÁC NHÂN KHÁC
HO T TÍNH C A XYLANASE

N

Nh ng nh h ng c a các ion kim lo i khác nhau và các tác nhân
khác đ n ho t tính c a xylanase tinh s ch đã đ c ki m tra b ng cách
nh ng enzyme này v i s có m t c a các tác nhân 40°C trong 1 gi . Ho t
tính t ng đ i đã đ c kh o sát theo ph ng pháp chu n. Ho t tính c a
xylanase tinh s ch đã b c ch b i m t s ion kim lo i nh Hg2+, Cu2+,
Ag+, Fe2+, Co2+, Mn2+, và Zn2+. Tuy nhiên, Ca2+ và Mg2+ có th tác
đ ng t i xylanase. Xylanase đã b nh h ng m nh nh t b i EDTA, kìm
hãm 83.4%. K t qu chi ti t ch ra trong b ng 2.
XÁC

NH CÁC THÔNG S

NG H C

Giá tr km cân b ng Michaelis và Vmax c a xylanase đã đ c xác
đ nh b i th nghi m enzyme tinh s ch v i gia t ng ng u nhiên n ng đ
xylan lúa mì t 0,5-0,8mg.nhi t đ , pH, và l ng enzyme đã đ c gi cùng
đi u ki n nh ho t tính enzyme chu n đã đ c mơ t
trên. Giá tr km và
Vmax cho xylanase đã đ c tính tốn d a trên đ th Lineweaver-Burk (t
1979). Các giá tr km và Vmax đã đ c tính tốn là 6.6mg/ml và 982µmol

kh đ ng xylose min-1, mg-1, protein theo th t . trong s th y phân xylan
lúa mì.
TH O LU N
Xylanase là polimer sinh h c giàu th hai ch sau cellulose. Và là m t
lo i polysaccharide hemicellulose chính đ c tìm th y thành t bào th c
v t (Timell, 1967).xylanase đã thu hút đ c nhi u nghiên c u b i vì ti m
n ng ng d ng trong công nghi p c a chúng. VD: xylanase đ c s d ng đ
làm t ng ch t l ng và t ng k t c u c a các s n ph m bánh mì, kh đ c
m t l ng Clo c n thi t đ làm tr ng b t gi y và làm gia t ng ch t l ng
dinh d ng trong kh u ph n n c a gia c m (Gilbert và Hazewood, 1993).


ho c
Nghiên c u này nh m m c tiêu phân l p các ch ng vi sinh v t có th
s n xu t xylanase cho nhu c u công nghi p. Các ch ng vi sinh v t khác nhau
đ c phân l p t m u đ t nh nuôi c y làm giàu. Ch ng Aspergillus
awamori SH-2016 có kh n ng sinh m t l ng l n xylanase đã đ c phân
l p và l a ch n nh là m t ch ng t t nh t cho nh ng nghiên c u ti p theo
c a chúng tơi. Nói chung, các vi sinh v t đ c gi ng nhau trong nh ng đ c
đi m hình thái.


ho c


ho c


ho c
Tuy nhiên, nh ng ph ng pháp nh n bi t này th ng là có v n đ vì

có th có s khác nhau hình thái/biotypes (morpho/biotypes) trong cùng m t
loài duy nh t. ng i ta c ng m t nhi u th i gian và k n ng c n thi t.
ph ng pháp phân tích trình t DNA là m t ph ng pháp khách quan,
reproducible, và là ph ng pháp nh n bi t nhanh chóng vì v y đ c ng i
ta s d ng r ng rãi. Trong cách ti p c n sinh h c phân t này, chi n l c
c a chúng tôi đã nh n bi t đ c s i n m kh trùng nh k t qu so sánh trình
t rDNA c ng nh phân tích cây phát sinh đ c th c hi n trong m t s pha
c a các gi i pháp phân lo i khác nhau (Liu et al., 2008).
Ph ng pháp PCR đã đ c s d ng r ng rãi cho vi c phân tích vùng
riboxom đ c tr ng c a các loài n m khác nhau (Gardes và Bruns, 1993).
C u trúc riboxom c a c th c v t và n m là c m nh ng vùng gen l p l i
(Erland et al., 1994). Tách vùng ITS t gen 17S và 25S có th đ c khu ch
đ i nh các m i đ c hi u đ c neo hai đ n v này. a hình vùng ITS hay
đ c s d ng đ phân lo i nh ng ngày nay nó th ng đ c s d ng đ nh n
bi t các loài n m gi ng nhau.trong nghiên c u này chúng tôi đã k t h p
ph ng pháp so sánh đ c đi m hình thái, sinh lý đ nh n ra v trí di truy n
c a các ch ng sinh xylanase đ c phân l p. ngày nay, có nhi u gen xylanase
đã đ c phân l p và đ c phân tích đ c đi m (Ghost et al., 1993; Haltrich et
al., 1996; Ito et al., 1993; Ziaie-Shikolaee et al., 2008). H n n a m t s sinh
h c phân t c a nh ng enzyme này đã đ c nghiên c u (Alam et al., 1994;
Eliger et al., 1994; Patel và Ray et al 1994; Tsujibo et al., 1990; Wang et
al.,1993; Moreau et al., 1994; Kulkarni et al., 1999). Trong nghiên c u này,
m t ch ng m i A.awamori SH-2016 m i đ c phân l p và nh n ra là có th
sinh xylanase, gen mã hóa xylanase đã đ c nhân dịng và bi u hi n thành
cơng, gen mà đã sinh m t l ng l n xylanase.
M t s ion có th nh h ng đ n ho t tính c a xylanase, m t s ion
kim lo i đã ch ra r ng có nh h ng b n v ng trong các ph n ng có m t
xylanase xúc tác. M t trong các đ c đi m thú v c a enzyme này là pH t t
nh t cho xylanase tái t h p kho ng 5.0. khi đó có ho t đ ng th y phân hi u
qu , lúa mì g n 4.5. pH na là kho ng ho t đ ng t t nh t c a xylanase đã

đ c phân l p t vi khu n.đi u này đã g i ý m t l n n a r ng xylanase t
Aspergillus awamori SH-2016 có th có l i đ tiêu hóa l ng xylan d có
trong d dày đ ng v t d i đi u ki n acid.
ng th i enzyme này nh y c m
v i nhi t đ .
c i thi n tính ch u nhi t và ho t tính c a xylanase ng d ng
trong cơng nghi p xylanase có th đ c c i bi n nh thi t k h p lý protein
ho c c i bi n tr c ti p s ti n hóa phân t c a protein (Miyazaki et al., 2006;
Liu et al., 2006) đang đ c ti p t c trong các nghiên c u ti p theo c a chúng


ho c
tơi. Các thí nghi m xác đ nh đ c đi m đã thu đ c m t l ng l n thông tin
liên quan đ n sinh hóa c a xylanase này đã đ a ra m t kh n ng cho lo i
xylanase này có th ng d ng trên cơng nghi p.
Có nhi u lo i n m men trong công nghi p đã đ c s d ng nh
nh ng h th ng tái t h p đ s n xu t xylanase (Damaso et al., 2003).
Nh ng lo i sinh v t này có th thao tác di truy n d dàng v i kh n ng th c
hi n nhi u c i bi n sau d ch mã trong nhi u sinh v t nhân chu n (Cereghino
et al., 2002). M t trong nh ng h th ng th ng đ c s d ng là n m men
Pichia pastoris. Nh ng sinh v t này chi m t l phân b trong t bào ch đ
cho bi u hi n và s n xu t xylanase(Berrin et al., 2000). Quan tr ng nh t nó
có th phát tri n thu n l i trong môi tr ng đ n gi n và r ti n và không ti t
b t k m t lo i xylanase n i bào nào (Berrin et al., 2000). Trong thí nghi m
này, xylanase t A. awamori SH-2016 đã đ c nhân dòng và bi u hi n thành
công Pichia pastoris. S bi u hi n quá m c c a lo i xylanase này s làm
cho s hi u bi t v c u trúc c a enzyme đ c d dàng h n và có th d n đ n
s n xu t m t l ng l n xylanase xúc tác sinh h c hi u qu .
L IC M N
Nghiên c u này đ c s h tr c a ch ng trình nghiên c u c a s

khoa h c công ngh t nh Cát Lâm (No[S ]. 2000567-1) và Qu Khoa h c t
nhiên c a T nh Chi t Giang (s Y506136).

L I NG

I D CH:

ây là l n đ u tiên, mình d ch t p chí ch c h n có r t nhi u l i và nhi u ch
ch a đ t v l i ki n th c ti ng anh c a mình cịn r t h n ch vì v y r t mong
đ c s góp ý nh n sét c a các b n, anh ch , th y cơ…
Nh ng ch mà mình d ch ch a đ
M i ý ki n đóng góp xin g i v :

c ng ý đã có đánh d u b ng màu khác.

Email:
Ho c:
Cám n các b n !



×