ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN
TRƢỜNG ĐẠI HỌC SƢ PHẠM
------ ------
ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN
TRƢỜNG ĐẠI HỌC SƢ PHẠM
------ ------
BÙI THỊ HÀ
BÙI THỊ HÀ
NGHIÊN CỨU XẠ KHUẨN THUỘC CHI STREPTOMYCES
NGHIÊN CỨU XẠ KHUẨN THUỘC CHI STREPTOMYCES
SINH CHẤT KHÁNG SINH CHỐNG NẤM GÂY BỆNH
SINH CHẤT KHÁNG SINH CHỐNG NẤM GÂY BỆNH
TRÊN CÂY CHÈ Ở THÁI NGUYÊN
TRÊN CÂY CHÈ Ở THÁI NGUYÊN
Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm
Mã số:
60.42.30
LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC
LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC
NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC
TS. VI THỊ ĐOAN CHÍNH
THÁI NGUYÊN - 2008
THÁI NGUYÊN - 2008
LỜI CẢM ƠN
LỜI CAM ĐOAN
Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới cô giáo TS. Vi Thị Đoan Chính
đã tận tình giúp đỡ tôi trong quá trình thực hiện và hoàn thành luận văn này.
Xin chân thành cảm ơn ThS. Nguyễn Phú Hùng và các cán bộ của bộ
môn Sinh học thuộc Khoa KHTN & XH - ĐHTN đã nhiệt tình giúp đỡ tôi.
Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cứu của riêng tôi. Các số
liệu, kết quả nghiên cứu trong luận văn là trung thực và chƣa từng đƣợc công
bố trong bất kỳ công trình nào khác.
Xin chân thành cảm ơn PGS. TS. Ngô Đình Quang Bính và các cán bộ
phòng Di truyền vi sinh học - Viện Công nghệ sinh học thuộc Viện khoa học
và công nghệ Việt Nam.
Xin cảm ơn Ban lãnh đạo Trƣờng Đại học Y - Dƣợc Thái Nguyên,
Thái nguyên, ngày 15 tháng 9 năm 2008
Tác giả
Khoa Sinh - KTNN, Khoa Sau Đại học - Trƣờng Đại học Sƣ phạm - ĐHTN
đã tạo nhiều điều kiện để tôi hoàn thành luận văn này.
Xin cảm ơn Ban chủ nhiệm khoa KHCB, Bộ môn Hóa - sinh đã tạo mọi
điều kiện cho tôi đƣợc học tập và hoàn thành luận văn này.
Tôi xin cảm ơn các thầy cô, bạn bè đồng nghiệp đã động viên, tạo mọi
điều kiện giúp đỡ tôi trong suốt quá trình làm luận văn.
Lời cảm ơn sâu sắc nhất tôi xin dành cho gia đình và những ngƣời thân
yêu của tôi.
Bùi Thị Hà
MỤC LỤC
1.4.1. Một số bệnh hại chè do nấm......................................................18
Trang
Trang phụ bìa
Lời cảm ơn
Lời cam đoan
Mục lục
Những chữ viết tắt
Danh mục các bảng
Danh mục các hình vẽ, đồ thị
MỞ ĐẦU..........................................................................................................1
Chƣơng 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU
1.1. GIỚI THIỆU VỀ XẠ KHUẨN..................................................................3
1.1.1. Phân bố của xạ khuẩn trong tự nhiên............................................3
1.1.2. Đặc điểm hình thái của xạ khuẩn..................................................4
1.1.3. Sự hình thành bào tử của xạ khuẩn...............................................5
1.1.4. Cấu tạo của xạ khuẩn....................................................................6
1.2. CÁC PHƢƠNG PHÁP PHÂN LOẠI XẠ KHUẨN HIỆN ĐẠI... ...........8
1.2.1. Đặc điểm hình thái và tính chất nuôi cấy.....................................8
1.2.2. Đặc điểm hóa phân loại (Chemotaxonomy)..................................9
1.2.3. Đặc điểm sinh lý - sinh hóa.........................................................10
1.2.4. Phân loại số (Numerical taxonomy)............................................10
1.2.5. Phân loại xạ khuẩn chi Streptomyces..........................................11
1.3. CHẤT KHÁNG SINH TỪ XẠ KHUẨN.................................................12
1.3.1. Lƣợc sử nghiên cứu chất kháng sinh...........................................12
1.3.2. Sự hình thành chất kháng sinh ở xạ khuẩn..................................15
1.3.3. Các yếu tố ảnh hƣởng đến sinh tổng hợp chất kháng sinh........16
1.4. MỘT SỐ BỆNH HẠI CHÈ DO NẤM GÂY RA VÀ ỨNG DỤNG CỦA
CKS TRONG BẢO VỆ THỰC VẬT..................................................18
1.4.2. Các chất kháng sinh trong bảo vệ thực vật.................................21
Chƣơng 2 - NGUYÊN LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
2.1. Nguyên liệu và hóa chất.........................................................................24
2.1.1. Nguyên liệu................................................................................24
2.1.2. Hóa chất, dụng cụ và thiết bị.................. ...................................24
2.2. Phƣơng pháp nghiên cứu..........................................................................27
2.2.1. Phƣơng pháp phân lập nấm gây bệnh từ các mẫu chè...........................27
2.2.2. Phân lập và tuyển chọn xạ khuẩn..........................................................28
2.2.2.1. Phân lập xạ khuẩn theo Vinogradski........................................28
2.2.2.2. Xác định hoạt tính kháng sinh ................................................28
2.2.2.3.Tuyển chọn các chủng xạ khuẩn sinh chất kháng sinh............29
2.2.3. Bảo quản giống......................................................................................29
2.2.4. Nghiên cứu các đặc điểm sinh học và phân loại xạ khuẩn....................30
2.2.4.1. Đặc điểm hình thái...................................................................30
2.2.4.2. Đặc điểm nuôi cấy....................................................................31
2.2.4.3. Đặc điểm sinh lý - sinh hóa......................................................31
2.2.5. Lên men tạo kháng sinh.........................................................................32
2.2.5.1. Lựa chọn môi trƣờng lên men thích hợp .................................32
2.2.5.2. Ảnh hƣởng của nguồn cacbon..................................................33
2.2.5.3. Ảnh hƣởng của nguồn Nitơ......................................................33
2.2.6. Các phƣơng pháp sinh học phân tử trong phân lập gen 16S - rRNA....33
2.2.6.1. Tách chiết DNA của xạ khuẩn bằng đệm CTAB.....................33
2.2.62. Khuếch đại gen 16S - rRNA bằng phản ứng PCR...................34
2.2.6.3. Phƣơng pháp điện di trên gel agarose......................................35
2.2.7. Phƣơng pháp xử lý số liệu.....................................................................36
Chƣơng 3 - KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
3.1. Phân lập và thuần khiết các chủng nấm gây bệnh trên chè......................37
3.2. Phân lập và tuyển chọn xạ khuẩn.............................................................38
NHỮNG CHỮ VIẾT TẮT TRONG LUẬN VĂN
3.2.1. Hoạt tính kháng nấm của các chủng xạ khuẩn............................38
3.2.2. Tuyển chọn các chủng xạ khuẩn có HTKN cao..........................41
3.3. Đặc điểm sinh học và đặc điểm phân loại của 2 chủng XK Đ1 và R2....42
3.3.1. Đặc điểm hình thái......................................................................42
3.3.2.Đặc điểm nuôi cấy........................................................................43
3.3.3. Đặc điểm sinh lý - sinh hóa.........................................................45
* Khả năng đồng hóa các nguồn cacbon...............................................45
* Nhiệt độ sinh trƣởng thích hợp .........................................................46
* Khả năng chịu muối...........................................................................46
* Khả năng sinh enzym ngoại bào........................................................47
3.3.4. Hoạt tính kháng sinh của 2 chủng R2 và Đ1..............................48
3.3.5. Vị trí phân loại của hai chủng xạ khuẩn R2 và Đ1....................50
3.4. Khả năng sinh tổng hợp CKS của 2 chủng xạ khuẩn đã lựa chọn...........52
3.4.1. Lựa chọn môi trƣờng lên men thích hợp.....................................52
3.4.2. Ảnh hƣởng của nguồn cacbon.....................................................54
3.4.3. Ảnh hƣởng của nguồn nitơ..........................................................56
3.5. Phân loại các chủng xạ khuẩn theo phƣơng pháp sinh học phân tử........57
3.5.1. Kết quả tách chiết DNA tổng số của các chủng xạ khuẩn..........57
3.5.2. Kết quả nhân gen 16S - rRNA bằng phản ứng PCR..................58
Chƣơng 4 - KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ
4.1. Kết luận.........................................................................................60
4. 2. Kiến nghị về những nghiên cứu tiếp theo.....................................61
CÔNG TRÌNH CÔNG BỐ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN VĂN....................62
TÀI LIỆU THAM KHẢO............................................................................63
XK
: Xạ khuẩn
VSV
: Vi sinh vật
CKS
: Chất kháng sinh
HSCC
: Hệ sợi cơ chất
HSKS
: Hệ sợi khí sinh
KTKS
: Khuẩn ty khí sinh
HTKS
: Hoạt tính kháng sinh
HTKN
: Hoạt tính kháng nấm
MT
: Môi trƣờng
KHVQH
: Kính hiển vi quang học
KHVĐT
: Kính hiển vi điện tử
DNA
: Deoxyribonucleic Acid
RNA
: Ribonucleic Acid
ISP
: International Streptomyces Project
TE
: Tris - Ethylendiamin tetracetic acid
SDS
: Sodiumdodecyl sulfat
TAE
: Tris - Acetate - Ethylendiamin tetracetic acid
PCR
: Polymerase chain reaction (phản ứng chuỗi polymerase)
DANH MỤC CÁC HÌNH VẼ, ĐỒ THỊ
DANH MỤC CÁC BẢNG
Trang
Bảng 3.1. Đặc điểm một số mẫu chè làm nguồn phân lập các chủng nấm.....37
Bảng 3.2. Xạ khuẩn có hoạt tính kháng nấm theo nhóm màu................................39
Bảng 3. 3.Tính đối kháng của xạ khuẩn với 3 chủng nấm gây bệnh trên chè.......40
Bảng 3. 4. Hoạt tính kháng nấm của 2 chủng xạ khuẩn..................................41
Bảng 3.5. Đặc điểm nuôi cấy của chủng R2 và Đ1.........................................44
Bảng 3.6. Khả năng đồng hóa nguồn cacbon của 2 chủng xạ khuẩn Đ1 và R2....45
Bảng 3.7. Nhiệt độ sinh trƣởng thích hợp của 2 chủng R2 và Đ1...................46
Bảng 3.8. Khả năng chịu muối của 2 chủng R2 và Đ1...................................47
Bảng 3.9. Hoạt tính kháng sinh của 2 chủng R2 và Đ1 với 3 chủng nấm
kiểm định.........................................................................................................48
Bảng 3.10. So sánh đặc điểm phân loại của chủng R2 với S. misawaensis....50
Bảng 3.11. So sánh đặc điểm phân loại của chủng Đ1 với A. brunneofungu.52
Bảng 3.12: Hoạt tính kháng sinh của 2 chủng xạ khuẩn trên các môi trƣờng
lên men khác nhau...........................................................................................53
Bảng 3.13. Ảnh hƣởng của nguồn cacbon lên khả năng sinh tổng hợp CKS
của 2 chủng R2 và Đ1.....................................................................................55
Bảng 3.14. Ảnh hƣởng của nguồn nitơ lên khả năng sinh tổng hợp CKS của 2
chủng R2 và Đ1...............................................................................................56
Trang
Hình 3.1. Ba chủng nấm phân lập từ các mẫu chè bị bệnh.............................38
Hình 3. 2. Tỷ lệ các chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng nấm theo nhóm màu.................39
Hình 3.3. Tỷ lệ các chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng nấm.........................40
Hình 3.4. Hoạt tính kháng nấm của 2 chủng xạ khuẩn lựa chọn.....................42
Hình 3.5. Cuống sinh bào tử và bề mặt bào tử chủng R2................................42
Hình 3.6. Cuống sinh bào tử và bề mặt bào tử chủng Đ1...............................43
Hình 3.7. Khả năng hình thành sắc tố melanin của 2 chủng...........................44
Hình 3.8. Hoạt tính enzym của các chủng xạ khuẩn.......................................47
Hình 3.9. Hoạt tính kháng 3 chủng nấm kiểm định của 2 chủng Đ1 và R2....49
Hình 3.10: Ảnh hƣởng của môi trƣờng đến khả năng tổng hợp CKS ............54
Hình 3.11: Ảnh hƣởng của nguồn cacbon đến khả năng tổng hợp CKS.........55
Hình 3.12 : Ảnh hƣởng của nguồn nitơ đến khả năng tổng hợp CKS.............57
Hình 3.13. Ảnh điện di DNA tổng số của 2 chủng xạ khuẩn.........................58
Hình 3.14. Ảnh điện di sản phẩm PCR của 2 chủng xạ khuẩn nghiên cứu.....59
-1-
-22. Mục tiêu nghiên cứu của đề tài
MỞ ĐẦU
- Phân lập và tuyển chọn các chủng xạ khuẩn thuộc chi Streptomyces có
1. Đặt vấn đề
Việt Nam là nước nông nghiệp nằm trong vùng nhiệt đới nóng ẩm.
hoạt tính kháng nấm gây bệnh trên cây chè.
Mưa là điều kiện rất thuận lợi cho VSV phát triển, đặc biệt là các VSV gây
- Nghiên cứu một số đặc điểm sinh học và đặc điểm phân loại của một
bệnh thực vật. Vì vậy việc sử dụng hoá chất trong bảo vệ thực vật từ lâu đã phổ
số chủng xạ khuẩn có hoạt tính chống nấm mạnh, có nhiều triển vọng ứng
biến ở Việt Nam. Song việc sử dụng hoá chất bảo vệ thực vật thường là độc hại
dụng.
và khi tồn dư trong đất, nước và nông sản sẽ ảnh hưởng nghiêm trọng tới sức
3. Đối tƣợng và nội dung nghiên cứu của đề tài
khoẻ con người, gây ô nhiễm môi trường và mất cân bằng sinh thái.
Chính vì vậy, Hội nghị tư vấn khu vực châu Á Thái bình dương của FAO
năm 1992 đã khẳng định đấu tranh sinh học là nền tảng của chương trình IPM
(Quản lý dịch hại tổng hợp) với chiến lược là sử dụng tác nhân sinh học để hạn
chế sự phát triển của các quần thể ký sinh. Một trong những hướng nghiên cứu
theo xu hướng này là sử dụng các tác nhân sinh học để hạn chế các quần thể
VSV gây bệnh. Trong số các tác nhân sinh học thường được sử dụng để ức chế
VSV gây bệnh, xạ khuẩn là nhóm có nhiều tiềm năng nhất vì tỷ lệ loài có khả
năng sinh CKS cao, trong đó có nhiều CKS có khả năng chống nấm mạnh.
Thái nguyên là tỉnh giàu tiềm năng về nông, lâm nghiệp. Trong đó cây
chè là cây loại cây chủ đạo và hàng năm các bệnh do nấm cũng đã gây ra
những thiệt hại nặng nề, làm giảm năng suất và chất lượng sản phẩm. Vì vậy
việc tìm kiếm các chủng xạ khuẩn có khả năng sinh chất kháng sinh chống
* Đối tượng nghiên cứu
- Các chủng xạ khuẩn sinh chất kháng sinh chống nấm phân lập từ đất
Thái Nguyên.
- Các chủng vi nấm gây bệnh trên cây chè ở Thái Nguyên.
* Nội dung nghiên cứu
1. Phân lập các chủng nấm gây bệnh trên cây chè để sử dụng làm VSV
kiểm định.
2. Phân lập và tuyển chọn các chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng nấm
từ các mẫu đất khác nhau.
3. Nghiên cứu một số đặc điểm sinh học và đặc điểm phân loại của một
số chủng xạ khuẩn có hoạt tính chống nấm mạnh đã được lựa chọn.
4. Nghiên cứu ảnh hưởng của một số điều kiện nuôi cấy đến khả năng
tạo thành CKS của các chủng đã lựa chọn.
nấm gây bệnh thực vật có tầm quan trọng đặc biệt góp phần vào công tác bảo
vệ thực vật và xây dựng nền nông nghiệp an toàn và bền vững.
Xuất phát từ những lý do trên, từ xu hướng nghiên cứu trên thế giới
hiện nay cũng như để góp phần khai thác nguồn vi sinh vật vô cùng phong
phú của Thái Nguyên. Chúng tôi thực hiện đề tài: “Nghiên cứu xạ khuẩn
thuộc chi Streptomyces sinh chất kháng sinh chống nấm gây bệnh trên cây
chè ở Thái Nguyên”.
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-3-
-4amylaza, xenluloza…một số axit amin và axit hữu cơ. Một số xạ khuẩn có thể
Chƣơng 1
gây bệnh cho người, động vật [7].
TỔNG QUAN TÀI LIỆU
1.1.2. Đặc điểm hình thái của xạ khuẩn
* Khuẩn lạc
1.1. GIỚI THIỆU VỀ XẠ KHUẨN
Đặc điểm nổi bật của xạ khuẩn là có hệ sợi phát triển, phân nhánh
1.1.1. Phân bố của xạ khuẩn trong tự nhiên
Xạ khuẩn (Actinobacteria) thuộc nhóm vi khuẩn thật (Eubacteria) phân
mạnh và không có vách ngăn (chỉ trừ cuống bào tử khi hình thành bào tử). Hệ
bố rất rộng rãi trong tự nhiên. Chúng có trong đất, nước, rác, phân chuồng,
sợi xạ khuẩn mảnh hơn của nấm mốc với đường kính thay đổi trong khoảng
bùn, thậm chí cả trong cơ chất mà vi khuẩn và nấm mốc không phát triển
0,2
được. Sự phân bố của xạ khuẩn phụ thuộc vào khí hậu, thành phần đất, mức
1 m đến 2
3 m, chiều dài có thể đạt tới một vài cm [10],[22].
Kích thước và khối lượng hệ sợi thường không ổn định và phụ thuộc
vào điều kiện sinh lý và nuôi cấy. Kích thước của hệ sợi xạ khuẩn là một
độ canh tác và thảm thực vật.
Theo Waksman thì trong một gam đất có khoảng 29.000 - 2.400.000
trong những đặc điểm phân biệt khuẩn lạc của xạ khuẩn và khuẩn lạc của nấm
mốc vì hệ sợi của nấm mốc có đường kính rất lớn, thay đổi từ 5
mầm xạ khuẩn, chiếm 9 - 45% tổng số VSV [43].
Sự phân bố của xạ khuẩn còn phụ thuộc nhiều vào độ pH môi trường,
50 m, dễ
quan sát bằng mắt thường.
chúng có nhiều trong các lớp đất trung tính và kiềm yếu hoặc axit yếu 6,8 - 7,5.
Khuẩn lạc của xạ khuẩn thường chắc, xù xì có dạng da, dạng vôi, dạng
Xạ khuẩn có rất ít trong lớp đất kiềm hoặc axit và càng hiếm trong các lớp đất
nhung tơ hay dạng màng dẻo. Khuẩn lạc xạ khuẩn có màu sắc khác nhau: đỏ,
rất kiềm, số lượng xạ khuẩn trong đất cũng thay đổi theo thời gian trong năm.
da cam, vàng, nâu, xám, trắng…tuỳ thuộc vào loài và điều kiện ngoại cảnh.
Một trong những đặc tính quan trọng nhất của xạ khuẩn là khả năng
hình thành chất kháng sinh, 60 - 70% xạ khuẩn được phân lập từ đất có khả
Kích thước và hình dạng của khuẩn lạc có thể thay đổi tuỳ loài và tuỳ
vào điều kiện nuôi cấy như thành phần môi trường, nhiệt độ, độ ẩm…
Đường kính mỗi khuẩn lạc chỉ chừng 0,5
năng sinh chất kháng sinh.
Cho tới nay khoảng hơn 8000 chất kháng sinh hiện biết trên thế giới thì
có tới 80% là do xạ khuẩn sinh ra [6]. Trong số đó có trên 15% có nguồn gốc
từ các loại xạ khuẩn hiếm như Micromonospora Actinomadura, Actinoplanes,
2 mm nhưng cũng có khuẩn
lạc đạt tới đường kính 1cm hoặc lớn hơn.
Khuẩn lạc có 3 lớp, lớp vỏ ngoài có dạng sợi bện chặt, lớp trong tương
đối xốp, lớp giữa có cấu trúc tổ ong.
Streptoverticillium, Streptosporangium… Điều đáng chú ý là các xạ khuẩn
Khuẩn ty trong mỗi lớp có chức năng sinh học khác nhau. Các sản
hiếm đã cung cấp nhiều chất kháng sinh có giá trị đang dùng trong y học như
phẩm trong quá trình trao đổi chất như: CKS, độc tố, enzym, vitamin, axit
gentamixin, tobramixin, vancomixin, rosamixi.
hữu cơ…có thể được tích luỹ trong sinh khối của tế bào xạ khuẩn hay được
Ngoài ra, xạ khuẩn tham gia tích cực vào các quá trình chuyển hoá
tiết ra trong môi trường.
nhiều hợp chất trong đất, nước. Dùng để sản xuất nhiều enzym như proteaza,
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-5-
-6-
* Khuẩn ty
Bào tử xạ khuẩn được bao bọc bởi màng muco polysaccharide giàu
Trên môi trường đặc, hệ sợi của xạ khuẩn phát triển thành 2 loại: một
protein với độ dày khoảng 300
400 A0 chia 3 lớp. Các lớp này tránh cho bào
loại cắm sâu vào môi trường gọi là hệ sợi cơ chất (khuẩn ty cơ chất substrate
tử khỏi những tác động bất lợi của điều kiện ngoại cảnh như nhiệt độ,
mycelium) với chức năng chủ yếu là dinh dưỡng. Một loại phát triển trên bề
pH…Hình dạng, kích thước chuỗi bào tử và cấu trúc màng bào tử là những
mặt thạch gọi là hệ sợi khí sinh (khuẩn ty khí sinh aerial mycelium) với chức
tính trạng tương đối ổn định và là đặc điểm quan trọng dùng trong phân loại
năng chủ yếu là sinh sản.
xạ khuẩn. Tuy nhiên những tính trạng này cũng có thể có những thay đổi nhất
Nhiều loại chỉ có hệ sợi cơ chất nhưng cũng có loại (như chi
Sporichthya) lại chỉ có hệ sợi khí sinh. Khi đó HSKS vừa làm nhiệm vụ sinh
sản vừa làm nhiệm vụ dinh dưỡng.
định khi nuôi cấy trên môi trường có nguồn nitơ khác nhau [13].
Muốn kích thích sự hình thành bào tử trước hết phải kích thích sự sinh
trưởng của khuẩn ty khí sinh. Nếu môi trường giàu dinh dưỡng quá thì quá
Độ dài của khuẩn ty xạ khuẩn trong giai đọan phát triển là 11 m/giờ
trình sinh bào tử thường bị kìm hãm. Trong nhiều trường hợp khi kích thích
[43] và chất nhân của tế bào xạ khuẩn sắp xếp đều đặn theo chiều dài của sợi.
sự hình thành bào tử, hiệu suất sinh tổng hợp CKS giảm đi.
Do đó một đoạn sợi (mầm xạ khuẩn) hoặc một bào tử xạ khuẩn gặp điều kiện
1.1.4. Cấu tạo của xạ khuẩn
thuận lợi sẽ trương lên, sau đó 1 - 2 giờ xuất hiện quá trình tổng hợp ARN,
Xạ khuẩn có cấu trúc tế bào tương tự như vi khuẩn Gram dương, toàn
nhân các gene cần thiết từ genom và tiến hành tổng hợp protein, cứ như vậy
bộ cơ thể chỉ là một tế bào bao gồm các thành phần chính: thành tế bào, màng
sợi được hình thành và phát triển. Một số xạ khuẩn có sinh ra nang bào tử bên
sinh chất, nguyên sinh chất, chất nhân và các thể ẩn nhập.
trong chứa các bào tử nang [7].
Thành tế bào của xạ khuẩn có kết cấu dạng lưới, dày 10 - 20 nm có tác
1.1.3. Sự hình thành bào tử của xạ khuẩn
dụng duy trì hình dáng của khuẩn ty, bảo vệ tế bào. Thành tế bào gồm 3 lớp:
Bào tử xạ khuẩn được hình thành trên các nhánh phân hóa của khuẩn ty
Lớp ngoài cùng dày khoảng 60
120A0, khi già có thể đạt tới 150
khí sinh - gọi là cuống sinh bào tử. Đó là cơ quan sinh sản đặc trưng cho xạ
200A0, lớp giữa rắn chắc, dày khoảng 50A0, lớp trong dày khoảng 50A0. Các
khuẩn. Hình thái, cuống sinh bào tử và bào tử là các đặc điểm quan trọng nhất
lớp này chủ yếu cấu tạo từ các lớp glucopeptide bao gồm các gốc N - axetyl
trong phân loại xạ khuẩn.
glucozamin liên kết với N - axetyl muramic bởi các liên kết 1,4 -
Cuống sinh bào tử của xạ khuẩn có dạng thẳng hoặc lượn sóng (RF),
Khi xử lý bằng lyzozym, các liên kết 1,4 -
glucozit.
glucozit bị cắt đứt, thành tế bào
dạng xoắn lò xo (S), chuỗi bào tử không phát triển hoặc xoắn đơn giản có
bị phá huỷ tạo thành thể sinh chất (protoplast), cấu trúc sợi cũng bị phá huỷ
hình móc câu (RA). Bào tử hình thành đồng thời trên tất cả chiều dài của
khi xử lý tế bào với hỗn hợp este chlorofom và các dung môi hoà tan lipit
cuống sinh bào tử theo 2 cách: kết đoạn hay cắt khúc và thường có hình trụ,
khác. Nguyên nhân là do lớp ngoài cùng có cấu tạo chủ yếu bằng lipit (thành
ovan, cầu, que với mép nhẵn hoặc xù xì, có gai hoặc gai phát triển dài thành
HSKS có nhiều lipit hơn so với HSCC) khác với nấm. Thành tế bào xạ khuẩn
dạng lông [9].
không chứa xenllulose và kitin nhưng chứa nhiều enzym tham gia vào quá
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-7-
-8-
trình trao đổi chất và quá trình vận chuyển vật chất qua màng tế bào [25],[30],
chất, chống chịu với nhiệt độ bất lợi, chống chịu với các kháng sinh, chuyển
[32], [35] [36].
gene, sản xuất các chất kháng sinh trong đất và môi trường tuyển chọn [3].
Căn cứ vào thành phần hoá học, thành tế bào xạ khuẩn được chia thành
Xạ khuẩn thuộc loại cơ thể dị dưỡng, nguồn cacbon chúng thường dùng
là đường, tinh bột, rượu và nhiều chất hữu cơ khác. Nguồn nitơ hữu cơ là
4 nhóm chính [6], [8].
Nhóm I: Thành phần chính của thành tế bào là axit L - 2,6
diaminopimelic (L - ADP) và glyxin. Chi Streptomyces thuộc nhóm này.
Nhóm II: Thành phần chính của thành tế bào là axit meso - 2,6 -
protein, pepton, cao ngô, cao nấm men. Nguồn nitơ vô cơ là nitrat, muối
amôn…Khả năng đồng hoá các chất ở các loài hay chủng xạ khuẩn khác nhau
là khác nhau.
1.2. CÁC PHƢƠNG PHÁP PHÂN LOẠI XẠ KHUẨN HIỆN ĐẠI
diaminopimelic (m - ADP) và glyxin.
Nhóm III: Thành phần chính của thành tế bào là axit meso - 2,6 -
Cùng với sự phát triển mạnh của sinh học phân tử, hóa sinh học, lý sinh
học...nên việc định tên một chủng xạ khuẩn được tiến hành tương đối nhanh
diaminopimelic.
Nhóm IV: Thành phần chính của thành tế bào là axit meso - 2,6 -
chóng và chính xác với nhiều phương pháp mới như phân loại số, nghiên cứu
chủng loại phát sinh...Song người ta vẫn chủ yếu dựa vào các đặc điểm hình
diaminopimelic, arabinose và galactose.
Dưới lớp thành tế bào là màng sinh chất dày khoảng 50 nm được cấu
tạo chủ yếu bởi 2 thành phần là photpholipit và protein. Chúng có vai trò đặc
biệt quan trọng trong quá trình trao đổi chất và quá trình hình thành bào tử
của xạ khuẩn.
thái, nuôi cấy đặc điểm sinh lý, sinh hóa, miễn dịch học và sinh học phân tử.
1.2.1. Đặc điểm hình thái và tính chất nuôi cấy
Đặc điểm hình thái và tính chất nuôi cấy là một trong những thông tin
quan trọng để phân loại xạ khuẩn. Để làm cho các chủng xạ khuẩn cần định
Nguyên sinh chất và nhân tế bào xạ khuẩn không có khác biệt lớn so
loại biểu hiện đầy đủ các đặc điểm, người ta thường xuyên nuôi cấy chúng
với tế bào vi khuẩn. Trong nguyên sinh chất của xạ khuẩn cũng chứa mezoxom
trên môi trường dinh dưỡng khác nhau trong điều kiện nhiệt độ và thời gian
và các thể ẩn nhập (các hạt polyphosphate: hình cầu, bắt màu với thuốc nhuộm
nhất định. Tiến hành quan sát mô tả chụp ảnh và ghi lại những đặc điểm hình
sudan III và các hạt polysaccharide bắt màu với dung dịch lugol).
thái và nuôi cấy của xạ khuẩn, đặc biệt là cơ quan mang bào tử, hình dạng và
Tuy nhiên, điểm khác biệt của xạ khuẩn so với các sinh vật prokaryote
ở chỗ chúng có tỷ lệ G + C rất cao trong DNA, thường lớn hơn 55%, trong
khi đó ở vi khuẩn tỷ lệ này chỉ là 25
bề mặt bào tử.
Theo Pridham và cộng sự [38], cuống sinh bào tử chia thành 3 nhóm:
RF cho những cuống sinh bào tử thẳng và lượn sóng. RA cho những cuống
45% [11].
Xạ khuẩn thuộc loại vi khuẩn Gram dương nên ngoài yếu tố di truyền
trong nhiễm sắc thể còn có các yếu tố di truyền ngoài nhiễm sắc thể, chúng có
sinh bào tử xoắn, thô sơ và ngắn. S cho những cuống sinh bào tử phát triển
mạnh và xoắn.
thể tự nhân lên mà được Lederberg gọi là plasmid. Các plasmid đem lại cho tế
Việc sử dụng các đặc điểm hình thái và tính chất nuôi cấy vẫn coi là
bào nhiều đặc tính chọn lọc quý giá như có thêm khả năng phân giải một số hợp
những dữ liệu cơ bản dùng trong phân loại xạ khuẩn. Tuy nhiên như ta đã biết
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-9-
-10-
xạ khuẩn rất không bền vững về mặt di truyền, thường xuyên xảy ra sự sắp
Trong phân loại xạ khuẩn thì typ thành tế bào là đặc điểm quan trọng
xếp lại trong phân tử DNA. Trong cùng một loài có thể biểu hiện khác nhau
nhất. Khi muốn đưa ra một loài mới hoặc mô tả một loài có ý nghĩa nào đó,
về hình thái hay những loài khác nhau có thể giống nhau về mặt hình thái. Vì
người ta không thể nào không xác định thành tế bào.
vậy để phân loại được chính xác, ngày nay người ta phải dùng thêm các chỉ
1.2.3. Đặc điểm sinh lý - sinh hóa
tiêu khác bổ sung như các đặc điểm sinh lý, sinh hóa, miễn dịch học hay sinh
Để phân loại xạ khuẩn đến loài, người ta sử dụng hàng loạt các đặc
học phân tử [45].
điểm sinh lý, sinh hóa khác như khả năng đồng hóa các nguồn cacbon và nitơ,
1.2.2. Đặc điểm hóa phân loại (Chemotaxonomy)
nhu cầu các chất kích thích sinh trưởng, khả năng biến đổi các chất khác nhau
Đặc điểm hóa phân loại được sử dụng rộng rãi và hiệu quả trong vòng
nhờ hệ thống enzym. Nhu cầu về oxy, giới hạn pH, nhiệt độ tối ưu, khả năng
20 năm trở lại đây. Đây là phương pháp cơ bản và có hiệu quả thông qua việc
chịu muối và các yếu tố khác của môi trường, mối quan hệ với chất kìm hãm
định tính và định lượng thành phần hóa học của tế bào VSV.
sinh trưởng và phát triển khác nhau, tính chất đối kháng và nhạy cảm với chất
Hóa phân loại chủ yếu dựa vào các đặc điểm sau:
kháng sinh, khả năng tạo thành chất kháng sinh và các sản phẩm trao đổi chất
- Typ thành tế bào dựa trên cơ sở phân tích axit amin trong thành phần
peptit và đường trong thành tế bào hay các polysaccarit gắn vào thành tế bào.
đặc trưng khác của xạ khuẩn.
Hopwood (1975) khẳng định rằng phần lớn các đặc điểm sinh lý - sinh
- Typ peptidoglycan (PG) dựa vào các thông tin về thành phần và cấu
hóa cùng đặc điểm nuôi cấy dễ bị biến động và có giá trị thấp về mặt phân
trúc của mạch tetrapeptit của PG cầu nối peptit và các liên kết giữa các mắt
loại. Do tính không ổn định và biến dị cao của xạ khuẩn mà ngày nay những
xích của PG.
nguyên tắc sử dụng các đặc điểm sinh lý - sinh hóa để phân loại xạ khuẩn
- Axit mycolic là các phần tử có mạch dài phân nhánh thuộc chi
Nocardia, Rhodococus, Mycobacterium và cornebacter. Đây là đặc điểm phân
loại cơ bản cho các chi đó.
cũng phải thay đổi [29].
1.2.4. Phân loại số (Numerical taxonomy)
Để phát hiện những loài mới trên cơ sở sự khác nhau về đặc điểm sinh
- Axit béo thường được sử dụng trong phân loại là axit béo bão hòa
lý, sinh hóa người ta còn sử dụng các kết quả dựa trên phân loại số.
mạch thẳng và không bão hòa với mạch phân nhánh kiểu iso và enteiso metyl
Phương pháp này dựa trên sự đánh giá về số lượng mức độ giống nhau
hóa ở nguyên tử cacbon thứ 10. Sự có mặt của axit 10 - metylloctade canoit
giữa các VSV theo một số lớn các đặc điểm chủ yếu là các đặc điểm hình
(axit tubereulostearinoic) là đặc điểm để phân loại đến chi [11].
thái, sinh lý, sinh hóa.
- Photpholipit có 5 typ photpholipit (P I, PII, PIII, PIV, PV) có thành phần
đặc trưng có ý nghĩa cho phân loại xạ khuẩn.
Để so sánh các chủng xạ khuẩn với nhau từng đôi một, người ta căn cứ
vào hệ số giống nhau (hệ số S - Similarity) có 2 công thức tính hệ số S hay
được sử dụng.
- Công thức của Sokal và Michener (SSM )
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-11SSM(AB)
NS
NS
NS
NS
Nd
-12mặt khuẩn lạc thường được phủ bởi KTKS dạng nhung, dày hơn cơ chất, đôi
100
khi có tính kỵ nước.
Xạ khuẩn chi Streptomyces sinh sản vô tính bằng bào tử. Trên đầu sợi
Trong đó: SSM : Mức độ giống nhau giữa hai cá thể A, B (%)
khí sinh hình thành cuống sinh bào tử và chuỗi bào tử. Cuống sinh bào tử có
NS+ : Số các tính trạng giống nhau
những hình dạng khác nhau tùy loài: thẳng, lượn sóng, xoắn, có móc, vòng ...
(AB)
Bào tử được hình thành trên cuống sinh bào tử bằng hai phương pháp
Nd : Số các tính trạng khác nhau
NS- Số các tính trạng đối lập nhau.
phân đoạn và cắt khúc. Bào tử xạ khuẩn có hình bầu dục, hình lăng trụ, hình
- Công thức của Jacard (SJ)
cầu với đường kính khoảng 1,5 µm. Màng bào tử có thể nhẵn, gai, khối u, nếp
:
S J (AB)
NS
nhăn...tùy thuộc vào loài xạ khuẩn và môi trường nuôi cấy.
NS
100
Nd
Thường trên môi trường có nguồn đạm vô cơ và glucoza, các bào tử
Trong đó: S J : mức độ giống nhau giữa hai chủng A, B (%)
(AB)
NS: Tổng số các đặc điểm dương tính (giống nhau) của hai chủng
biểu hiện các đặc điểm rất rõ. Màu sắc của khuẩn lạc và hệ sợi khí sinh cũng
rất khác nhau tùy theo nhóm Streptomyces, màu sắc này cũng có thể biến đổi
khi nuôi cấy trên môi trường khác nhau. Vì vậy mà ủy ban Quốc tế về phân
so sánh.
Nd : Tổng số các đặc điểm khác nhau (tổng số các đặc điểm
loại xạ khuẩn ISP đã nêu ra các môi trường chuẩn và phương pháp chung để
phân loại nhóm VSV này.
dương tính của chủng này và âm tính của chủng kia).
Kết quả cuối cùng của phân loại số là vẽ được sơ đồ phân nhánh (kiểu
Các loài xạ khuẩn thuộc chi Streptomyces có cấu tạo giống vi khuẩn
"rễ cây") của các thông số. Ở sơ đồ này những chủng giống nhau nhiều nhất
Gram dương, hiếu khí, dị dưỡng các chất hữu cơ. Nhiệt độ tối ưu thường là
được xếp vào một nhóm. Bằng phân loại số người ta chia xạ khuẩn chi
25 - 300C, pH tối ưu 6,5 - 8,0. Một số loài có thể phát triển ở nhiệt độ cao hơn
Streptomyces thành 2 nhóm lớn, 37 nhóm nhỏ và 13 cụm với những đại diện
hoặc thấp hơn (xạ khuẩn ưa nhiệt và ưa lạnh).
Xạ khuẩn chi này có khả năng tạo thành số lượng lớn các CKS ức
nhất định [44].
chế vi khuẩn, nấm sợi, các tế bào ung thư, virus và nguyên sinh động vật.
1.2.5. Phân loại xạ khuẩn chi Streptomyces
Chi Streptomyces là một giống xạ khuẩn bậc cao được Wakman và
Cho đến nay để xác định thành phần loài của chi Streptomyces, các nhà
Henrici đặt tên năm 1943 [43]. Đây là chi có số lượng loài được mô tả lớn
phân loại đã sử dụng hàng loạt các điều kiện và các khóa phân loại khác
nhất. Các đại diện chi này có HSKS và HSCC phát triển phân nhánh. Đường
nhau [48],[49].
kính sợi xạ khuẩn khoảng 1 - 10 µm, khuẩn lạc thường không lớn có đường
1.3. CHẤT KHÁNG SINH TỪ XẠ KHUẨN
kính khoảng 1 - 5 mm. Khuẩn lạc chắc, dạng da mọc đâm sâu vào cơ chất. Bề
1.3.1. Lƣợc sử nghiên cứu chất kháng sinh
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-13-
-14-
Theo định nghĩa của Outchinnikov [48]. Chất kháng sinh là chất có
Năm 1999 một kháng sinh mới khác được phát hiện có tác dụng ngăn
nguồn gốc thiên nhiên và các sản phẩm cải biến của chúng bằng con đường
chặn hiện tượng cholesterol, tăng sức đề kháng đối với các chất độc của
hóa học có khả năng tác dụng chọn lọc đối với sự phát triển của VSV, tế bào
chuột, ngoài ra kháng sinh này còn có hoạt tính chống nấm gây bệnh mạnh.
ung thư ở ngay nồng độ thấp.
Đó là kháng sinh loposomal HA - 92, được tách ra từ xạ khuẩn Streptomyces
Người đầu tiên đặt nền móng cho khoa học nghiên cứu CKS là
Alexander Fleming - Nhà sinh vật học người Anh, đã phát hiện ra penixillin
CDRLL - 312.
Năm 2003, nhiều nước trên thế giới vẫn tiếp tục phát hiện được hàng
loạt các CKS mới. Tại Nhật Bản, chất kháng sinh mới là yatakemycin đã
vào tháng 10 năm 1928.
Sau một thập kỷ, nhờ sự nỗ lực hợp tác của các nhà vi sinh học và sinh
được tách chiết từ xạ khuẩn Streptomyces sp. TP - A0356 bằng phương pháp
hóa học Anh, Mỹ, penixillin đã được nghiên cứu, sản suất với số lượng lớn và
sắc kí cột. CKS này có khả năng kìm hãm sự phát triển của nấm Aspergillus
trở thành "một loại thuốc thần kỳ". Năm 1945, A.Fleming, E. Chain và
fumigalus và Candida albicans. Ngoài ra chất này còn có khả năng chống lại
H.W.Florey đã được nhận giải thưởng Nobel vì đã khám phá ra giá trị to lớn
các tế bào ung thư với giá trị Mic là 0,01- 0,3 mg/ml [15].
của penixillin mở ra một kỷ nguyên mới trong y học - kỷ nguyên kháng sinh.
Những năm 1940 - 1959 được coi là thời kỳ hoàng kim của việc nghiên
cứu CKS với hàng loạt CKS mới liên tiếp được phát hiện như: gramixidin,
'
Năm 2007, tại Hàn Quốc đã phân lập được loài xạ khuẩn Streptomyces
sp. C684 sinh CKS laidlomycin, chất này có thể tiêu diệt cả những tụ cầu đã
kháng methicillin và các cầu khuẩn kháng vancomycin [47].
tiroxidin do Rene Jules Dubos phát hiện năm 1939, streptomycin do
Ngày nay, với sự phát triển mạnh mẽ của sinh học hiện đại cùng sự hỗ
Waksman phát hiện năm 1941, erythomycin do Gurre phát hiện năm 1952...
trợ của nhiều ngành khoa học khác đã giúp cho việc tìm kiếm và ứng dụng
Cùng với việc phát hiện ra các CKS mới, công nghệ lên men sản xuất CKS
CKS đạt được những thành tựu rực rỡ. Để sản xuất CKS con người không chỉ
cũng ra đời và dần được hoàn thiện [31].
tìm kiếm những chủng VSV sinh CKS từ tự nhiên mà còn cải tạo chúng bằng
Ngay từ những năm 1950, CKS đã được nghiên cứu sử dụng trong việc
nhiều phương pháp như dùng kỹ thuật di truyền và công nghệ gene, gây đột
phòng chống bệnh, kích thích sự tăng trưởng của động vật nuôi và cây trồng.
biến định hướng, chọn dòng gene sinh tổng hợp, tạo và dung hợp tế bào trần
CKS thu hút được sự quan tâm của các nhà khoa học thuộc nhiều lĩnh vực
để tạo ra các chủng có HTKS cao, đồng thời nhằm mục đích tìm kiếm các loại
khác nhau trên thế giới.
kháng sinh mới và quý trong thời gian ngắn [7],[41].
Tốc độ tìm kiếm các CKS trong thời gian gần đây vẫn diễn ra nhanh
Những thành tựu gần đây trong sinh học phân tử như tái tổ hợp ADN,
chóng, nhiều trung tâm nghiên cứu khoa học về y học, dược phẩm và nông
kỹ thuật tách dòng gene và biểu hiện tổng hợp ở vi khuẩn E.coli không những
nghiệp tại nhiều nước trên thế giới vẫn liên tục phát hiện được hàng loạt các
đem lại kết quả to lớn trong phát triển chủng giống mà còn mở ra phương
CKS mới có giá trị ứng dụng trong thực tiễn.
hướng đầy triển vọng trong sản xuất các CKS.
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-15-
-16-
1.3.2. Sự hình thành chất kháng sinh ở xạ khuẩn
1.3.3. Các yếu tố ảnh hƣởng đến sinh tổng hợp chất kháng sinh
Một trong những đặc điểm quan trọng nhất của xạ khuẩn là khả năng
hình thành CKS. Trong số 8000 CKS hiện biết trên thế giới có trên 80% là có
1.3.3.1. Ảnh hưởng của điều kiện nuôi cấy
* Nhiệt độ
Nhiệt độ có ảnh hưởng rất lớn đến sinh trưởng và khả năng tổng hợp
nguồn gốc từ xạ khuẩn [6].
Một trong những tính chất của các CKS có nguồn gốc từ VSV nói
CKS của xạ khuẩn. Đa số các xạ khuẩn phát triển tốt ở nhiệt độ 28 - 300C,
chung và từ xạ khuẩn nói riêng là có tác dụng chọn lọc. Mỗi CKS chỉ có tác
nhưng nhiệt độ tối ưu cho sinh trưởng tổng hợp CKS thường chỉ nằm trong
dụng với một nhóm VSV nhất định. Hầu hết CKS có nguồn gốc xạ khuẩn đều
khoảng 18 - 280C [20].
có phổ kháng khuẩn rộng. Khả năng kháng khuẩn của các CKS là một đặc
* pH môi trường
điểm quan trọng để phân loại xạ khuẩn.
Sinh tổng hợp chất kháng sinh phụ thuộc rất nhiều vào pH môi trường.
Có nhiều quan điểm khác nhau về khả năng hình thành CKS. Một số
pH tác động trực tiếp đến tính chất hệ keo của tế bào, đến hoạt lực của các
tác giả cho rằng sự hình thành CKS là do cơ chế giúp cho VSV tồn tại trong
enzym và tác động gián tiếp qua môi trường. pH thích hợp cho sinh tổng hợp
môi trường tự nhiên. Số khác cho rằng, sự hình thành CKS là do sự cạnh
CKS thường là trung tính, pH kiềm hay axit đều ức chế quá trình tổng hợp
tranh trong môi trường dinh dưỡng. Hầu hết các tác giả cho rằng kháng sinh
CKS [24],[46].
là sản phẩm chuyển hóa thứ cấp được hình thành vào cuối pha tích lũy thừa,
* Độ thông khí
đầu pha cân bằng của chu kỳ sinh trưởng [5].
Xạ khuẩn là loại VSV có nhu cầu thông khí cao hơn so với các VSV
Mặc dù CKS có cấu trúc khác nhau và VSV sinh ra chúng cũng đa dạng,
nhưng quá trình sinh tổng hợp chúng chỉ theo một số con đường nhất định.
- CKS được tổng hợp từ một chất chuyển hóa sơ cấp, thông qua một
chuỗi phản ứng enzym.
khác, nhất là ở giai đoạn nhân giống (khoảng từ giờ thứ 6 đến giờ thứ 12 của
quá trình nuôi cấy)[21]. Do vậy để đảm bảo thông khí tốt, người ta thường bổ
sung vào môi trường lên men benzilthioxyanat... làm tăng khả năng hòa tan
oxy. Nồng độ oxy thích hợp cho sinh tổng hợp CKS là 2 - 8ml O2/ 100ml
- CKS được hình thành từ hai hoặc ba chất chuyển hóa sơ cấp khác nhau.
môi trường lên men [8].
- CKS được hình thành bằng con đường polyme hóa các chất chuyển
* Tuổi giống
hóa sơ cấp, sau đó tiếp tục biến đổi qua các phản ứng enzym khác.
Việc tổng hợp CKS không chỉ phụ thuộc vào điều kiện lên men, mà
Nhiều chủng xạ khuẩn có khả năng tổng hợp đồng thời hai hay nhiều
còn phụ thuộc vào chất lượng của bào tử và giống sinh dưỡng. Tuổi giống
CKS có cấu trúc hóa học và có tác dụng tương tự nhau. Quá trình sinh tổng
cấy truyền vào môi trường lên men cho hiệu suất CKS cao nhất thường là 24
hợp CKS phụ thuộc vào cơ chế điều khiển đa gene, ngoài các gene chịu trách
giờ tuổi. Lượng giống cấy truyền khoảng từ 2 - 10% [14].
nhiệm tổng hợp CKS, còn có cả các gene chịu trách nhiệm tổng hợp các tiền
chất, enzym và cofactor.
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-17-
-18-
1.3.3.2. Ảnh hưởng của thành phần môi trường lên men
Đây là thành phần không thể thiếu trong môi trường lên men. Nếu môi
CKS là sản phẩm thứ cấp nên quá trình sinh tổng hợp CKS phụ thuộc
trường lên men có nguồn dinh dưỡng tự nhiên thì hầu hết các nguyên tố vi
chặt chẽ vào thành phần môi trường dinh dưỡng. Trước hết là nguồn cacbon,
lượng đã có sẵn. Việc bổ sung các chất giàu nguyên tố vi lượng vào môi
nitơ, tỷ lệ C/N và các chất khoáng...[5],[26],[29].
trường sẽ làm thay đổi đáng kể khả năng tổng hợp CKS của nhiều chủng xạ
* Nguồn cacbon
khuẩn.
Các hợp chất cacbon có ý nghĩa hàng đầu trong sự sinh trưởng và hình
* Hình thức lên men
thành CKS. Đối với nhiều chủng xạ khuẩn, nguồn cacbon thích hợp là tinh
Trong tổng hợp CKS, phương pháp nuôi cấy cũng là một trong những
bột. Tuy nhiên, tùy từng chủng khác nhau mà khả năng sử dụng các loại
yếu tố quyết định. Khi nuôi cấy bề mặt, đặc điểm hai pha thường không quan
đường là khác nhau, có chủng sử dụng tốt các loại đường đơn như glucoza,
sát thấy và CKS được tạo thành trong suốt pha sinh trưởng. Quá trình sản
mannoza, fructoza...có chủng sử dụng tốt loại đường đôi như sacaroza,
xuất CKS thường được tiến hành theo phương pháp nuôi cấy chìm trong nồi
maltoza...Ngoài ra một số chủng còn có thể sử dụng các loại acid hữu cơ và
lên men có cách khuấy đảo và sục khí.
chất béo làm nguồn thức ăn cacbon trong lên men sinh CKS.
1.4. MỘT SỐ BỆNH HẠI CHÈ DO NẤM GÂY RA VÀ ỨNG DỤNG
* Nguồn nitơ
CỦA CKS TRONG BẢO VỆ THỰC VẬT
Hầu hết các chủng xạ khuẩn sinh CKS đều đòi hỏi cả hai nguồn nitơ
hữu cơ và vô cơ. Nguồn nitơ hữu cơ thích hợp nhất thường là các hợp chất từ
1.4.1. Một số bệnh hại chè do nấm
1.4.1.1. Bệnh phồng lá chè
thực vật như bột đậu tương, cao ngô. Cao ngô là nguồn bổ sung cả nitơ và
Bệnh được phát hiện năm 1868 ở Ấn Độ, nhưng đến năm 1895 Masse mới
protein, tuy nhiên lượng phốt phát vô cơ trong cao ngô cao sẽ ức chế sinh
nghiên cứu phát hiện nguyên nhân gây bệnh. Bệnh do nấm Esobasidium
tổng hợp CKS[27]. Nguồn nitơ vô cơ thường sử dụng là muối amon. Muối
vexans Mase gây ra [1],[4].
nitrat không thích hợp cho sự sinh tổng hợp CKS của nhiều chủng xạ khuẩn.
* Nguồn photphat vô cơ
Bệnh phát sinh ở lá non, cành non, vết bệnh phần lớn ở mép lá. Đầu tiên
trên lá xuất hiện những chấm nhỏ hình giọt dầu màu vàng nhạt. Sau đó vết
Photphat vô cơ đóng vai trò như là tác nhân điều chỉnh sinh tổng hợp
bệnh lớn dần, màu nhạt dần. Phía dưới vệt bệnh (mặt dưới lá) phồng lên và
CKS. Nồng độ photphat thích hợp cho sinh tổng hợp CKS thường không
mặt trên lõm xuống, phía lồi có hạt phấn màu trắng, có giới hạn rõ rệt với phần
vượt quá 10 mg/ml. Nồng độ photphat ban đầu cao sẽ làm tăng lượng axit
lá khoẻ. Cành bị nấm hại sẽ bị chết [50].
nucleic dẫn đến kéo dài pha sinh trưởng, rút ngắn pha tổng hợp, làm tăng
Đám bào tử (Basidiospore) của nấm bệnh có hình gậy, phía đỉnh phân
ATP trong tế bào, dẫn đến giảm hoặc ngừng hẳn sinh tổng hợp CKS.
nhánh, mỗi nhánh đính một bào tử có hình bầu dục hoặc hình thận không màu.
* Các yếu tố vi lượng
Lúc đầu bào tử là đơn bào, về sau ở giữa có vách ngăn tạo thành hai bào tử.
Bào tử rất dễ rụng.
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-19-
-20-
Dưới điều kiện độ ẩm cao, nhiệt độ thấp bệnh phát sinh mạnh. Các thời
điểm bệnh thường phát sinh mạnh là tháng 3 đến tháng 5 và tháng 9 đến tháng
10. Nhiệt độ thích hợp là 15
1.4.1.3. Bệnh đốm trắng
Ở Việt Nam, bệnh đốm trắng có ở mọi vùng chè, phát sinh trên vườn
chè mới trồng, gây hại ở lá non và cành non. Mùa mưa bệnh phát sinh mạnh
0
20 C.
nhất. Tác nhân gây bệnh là do nấm Phyllosticta theafolia Hara [4].
1.4.1.2. Bệnh đốm nâu
Lúc đầu vết bệnh còn nhỏ, hình tròn, màu nâu phần giữa lõm xuống có
Bệnh đốm nâu (còn gọi là khô lá
chè hình bánh xe) là bệnh hại lá thường
màu trắng sáng, xung quanh có màu lông sẫm. Đường kính vết bệnh 0,5
thấy ở các nương chè Việt Nam. Bệnh
mm. Thời kỳ sau, nhiều vết nhỏ liên kết với nhau tạo thành vết lớn không có
phát sinh vào tháng 5, 6 mưa nhiều và
hình dạng nhất định, cuống lá bị bệnh dễ làm cho lá rụng. Bệnh có thể phát
bệnh phát sinh mạnh nhất vào tháng 8,
sinh ở tất cả cành non. Mặt trên vết bệnh có những vết nhỏ màu đen. Bệnh
9. Bệnh nặng có thể làm khô lá và rụng
đốm trắng có những nốt mốc và có những vết nhỏ hình mũi kim.
1,5
sớm. Tác nhân gây bệnh là do nấm
Sợi nấm hoặc bào tử tồn tại trong lá bị rụng hoặc ở cành cây để qua
Colletotrichum camelliae Masse [1],[4].
đông. Mùa xuân bào tử phát tán và xâm nhập vào các cành non và lá bánh tẻ.
Bệnh đốm nâu chủ yếu hại lá già, cành và quả. Trên lá vết bệnh bắt đầu
Nhiệt độ từ 18
250C rất thích hợp cho sự phát sinh của bệnh. Mùa xuân và
từ mép lá, màu nâu, không có hình dáng nhất định hoặc hình bán nguyệt.
mùa thu, mưa nhiều là điều kiện cho sự phát sinh mạnh. Trên các giống chè
Trên vết bệnh có các đường tròn đồng tâm, ở giữa vết bệnh lá bị khô, màu
lá nhỏ (như Đại bạch trà, Gruzia) bệnh cũng phát sinh mạnh.
xám tro đen lan dần theo hình gợn sóng bánh xe. Trên cành cũng có triệu
trứng như vậy, bộ phận bị bệnh có thể bị rách (vỡ) ra [50].
Bào tử nấm tồn tại trên vết bệnh và lá bệnh, thậm chí cả khi lá rơi
1.4.1.4. Bệnh đốm xám
Bệnh đốm xám là bệnh phổ biến
ở các vùng trồng chè. Bệnh phát sinh
xuống đất. Năm sau, khi nhiệt độ tăng lên, bào tử phát tán nhờ gió mưa
vào mùa mưa, nhiệt độ 27
truyền đến các lá chè và sau lây nhiễm 5
Bệnh nặng làm lá chè khô rụng, cây
18 ngày thì xuất hiện vết bệnh.
Bệnh ưa nóng ẩm nên thường phát sinh vào tháng 7, 8. Sau mưa liên tục
10
15 ngày bệnh phát triển rất nặng.
300C.
chè còi cọc. Tác nhân gây bệnh là do
nấm Pestalossia theae Sawada [1],[4].
Ở vùng đất thấp có mực nước ngầm cao, thoát nước không tốt, phân bón
Vết bệnh trên lá có màu nâu sẫm,
không đủ đều tạo điều kiện cho bệnh phát sinh. Trong quá trình chăm sóc
lúc đầu chỉ có chấm nhỏ màu đen sau đó lan ra khắp lá. Bệnh thường bắt đầu
chè bị xây xát nhiều, ánh sáng quá mạnh hoặc khi gặp mưa, bệnh phát sinh
từ mép lá và làm cho lá rụng. Vết bệnh có hình gợn sóng, trên vết bệnh có
càng nặng, giống chè lá to bệnh dễ phát sinh mạnh.
các hình vân đen. Lá thường bị rụng khi bệnh lan khắp lá hoặc 1/2 lá.
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-21-
-22-
Những điểm nhỏ trên lá là bào tử phân sinh đính trên cuống ngắn và
rõ rệt tỷ lệ mắc bệnh của cây. Thông thường, một loại xạ khuẩn đối kháng có
đính bào tử. Bào tử có 3 ngăn, đầu nhỏ có cuống, đầu lớn có 3 lông, bào tử
thể ức chế một vài loại nấm gây bệnh nhưng có những loài hoạt phổ rộng có
màu nâu xẫm.
thể ức chế nhiều tác nhân gây bệnh có trong đất.
1.4.1.5. Bệnh thối búp chè
Không phải tất cả các xạ khuẩn có hoạt tính kháng nấm invitro đều thể
Bệnh thối búp chè thường thấy ở
hiện trong đất (khoảng 4 - 5%) nhưng chúng có vai trò quan trọng trong việc
các nước trồng chè của vùng Châu Á.
ức chế nấm gây bệnh và ngăn ngừa khả năng nhiễm bệnh cho cây. Đây là
Bệnh này được phát hiện ở Phú Hộ từ
quy luật cân bằng sinh học trong tự nhiên. Nếu sự cân bằng mất đi, lập tức sẽ
năm 1961 - 1962 trên những nương chè
nảy sinh ra bệnh khi trong đất có mầm gây bệnh. Xạ khuẩn chống nấm ngoài
tăng sản và lấy hom giống. Tác nhân gây
việc tiết ra các CKS, còn tác động lên khu hệ VSV thông qua các enzym
bệnh là do nấm Colletotrichum theae
phân giải. Ngoài ra, nhiều XK còn tiết ra các chất kích thích sinh trưởng thực
Petch [4].
vật cũng như kích thích các khu hệ VSV có lợi trong vùng rễ [14].
Bệnh thường xuất hiện ở lá non, cuống lá và cành non. Vết bệnh lúc
đầu bằng đầu kim có màu đen, sau đó lan dần ra hết cả búp và cành chè. Sau
* Các chất kháng sinh có nguồn gốc xạ khuẩn trong phòng trừ nấm gâ y
bệnh thực vật
20 mm. Khi thời tiết nóng ẩm lá dễ
Để tránh dịch bệnh trong nông nghiệp, người ta có thể sử dụng một số
bị rụng. Trong vườn ươm thường hay bị nặng hơn ở nương chè hái búp. Từ
biện pháp kỹ thuật, như thay đổi cơ cấu cây trồng, mùa vụ. Tuy nhiên biện
tháng 7 đến tháng 9 thường có mưa kéo dài, bệnh dễ gây hại nặng. Nhiệt độ
pháp này gây xáo trộn hệ sinh thái đồng ruộng, tạo điều kiện để phát sinh một
10 ngày vết bệnh có thể dài tới 15
8
27 C và độ ẩm > 90% là điều kiện thuận lợi cho bệnh phát sinh. Bào tử nấm
số bệnh mà trước đây ít gặp. Việc tuyển chọn các dòng cây kháng bệnh cũng
lan truyền nhờ mưa gió. Chè để cành và vườn ươm bón nhiều phân đạm và
chỉ được vài năm, sau đó các tác nhân gây bệnh lại kháng lại.
0
trên nền thâm canh cao, thường bị bệnh nặng hơn.
Việc sử dụng CKS trong trồng trọt nhằm các mục đích như chống bệnh
1.4.2. Các chất kháng sinh trong bảo vệ thực vật
do nấm gây ra trên rau quả và cây trồng, chống bệnh do vi khuẩn gây ra, diệt
* Xạ khuẩn chống nấm gây bệnh thực vật
côn trùng và cỏ dại... kiềm chế các bệnh thực vật sinh ra từ đất. So với thuốc
Các nhà bệnh học thực vật trên toàn thế giới đã điều tra nghiên cứu
hóa học, dùng các CKS trong bảo vệ thực vật vừa có tác dụng nhanh, dễ phân
tình hình sử dụng CKS trong việc ngăn chặn các bệnh thực vật. Tuy còn ở
hủy, có tác dụng chọn lọc cao, độ độc thấp không gây ô nhiễm môi trường,
mức thấp nhưng đã thu được những thành tựu nhất định trong nền nông
còn có khả năng ức chế các VSV đã kháng thuốc hóa học. CKS và dịch lên
nghiệp hiện đại.
men các chủng sinh CKS còn dùng để xử lý hạt giống với mục đích tiêu diệt
Sự đối kháng giữa các VSV trong đất là cơ sở của biện pháp sinh học
nguồn bệnh ở bên ngoài và trong hạt, diệt bệnh cả ở các bộ phận nằm trên đất
phòng chống bệnh cây. Sự có mặt của xạ khuẩn đối kháng trong đất làm giảm
của cây và khử trùng đất [15].
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-23-
-24-
Ngày nay, việc sử dụng các CKS trong bảo vệ thực vật được phổ biến
rộng rãi trên thế giới nhất là ở các nước Nga, Nhật, Trung Quốc, Ấn Độ...Ở
Chƣơng 2
NGUYÊN LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
Trung Quốc đã tuyển chọn được nhiều chủng xạ khuẩn từ đất và nghiên cứu
sản xuất nhiều CKS phòng chống bệnh cây có hiệu quả cao như policin chống
2.1 NGUYÊN LIỆU VÀ HÓA CHẤT
bệnh đạo ôn, jangamicin chống bệnh khô vằn.
2.1.1. Nguyên liệu
Năm 2002, ở Ấn Độ đã phân lập được chủng Streptomyces sp. 201 có
khả năng sinh CKS mới là z - methylheptyl iso - nicotinate, chất kháng sinh
2.1.1.1 Mẫu cây
Mẫu nghiên cứu là các lá chè, búp chè bị bệnh thu thập từ các địa điểm
này có khả năng kháng được nhiều loại nấm gây bệnh như Fusarium
khác nhau của Thái Nguyên, được bảo quản trong tủ lạnh không quá 24 giờ.
oxysporum, F. solani...[15].
2.1.1.2. Mẫu đất
Ở Việt Nam cũng đã sử dụng nhiều chế phẩm kháng sinh trong bảo vệ
thực vật nhập từ Trung Quốc hay Nhật Bản và đã phân lập được một số chủng
xạ khuẩn có khả năng chống Pyricularia oryzae gây bệnh đạo ôn và F. oxysporum
gây bệnh thối rễ ở thực vật [2]. Tuy nhiên việc sử dụng CKS trong lĩnh vực
bảo vệ thực vật ở nước ta còn ở mức độ thấp bởi tập quán canh tác chỉ quen
dùng một số hóa chất bảo vệ thực vật nhất định.
Các mẫu đất được lấy ở các độ sâu 5 - 10 cm tại các địa điểm khác
nhau của tỉnh Thái Nguyên.
2.1.1.3. Vi sinh vật kiểm định
Ngoài các chủng nấm phân lập được từ các lá chè bị bệnh, 3 chủng nấm
gây bệnh thực vật được sử dụng làm VSV kiểm định là:
- Rhizoctonia solani VCM 3047
Ngoài ra, giá thành của các chế phẩm sinh học chưa phù hợp với điều
- Fusarium oxysporum VCM 3028
kiện sản xuất của người nông dân. Do đó cần có sự phối hợp thống nhất trong
- Fusarium moniliforme VCM 3027
việc nghiên cứu, sản xuất các chế phẩm phòng trị sinh học với việc truyền
Các chủng nấm này nhận được từ phòng Di truyền VSV - Viện Công
thông, xây dựng phương pháp canh tác mới nhằm thu được hiệu quả to lớn
nghệ Sinh học thuộc Viện khoa học và công nghệ Việt Nam.
trong phòng chống dịch bệnh, nâng cao năng suất cây trồng và hiệu quả kinh
2.1.2 Hóa chất, dụng cụ và thiết bị
tế đồng thời bảo vệ môi trường và sức khỏe con người [14].
2.1.2.1. Hóa chất
- Các loại đường chuẩn: glucose, saccarose, lactose, fructose,
mantose... của hãng Merck (Đức), Trung Quốc sản xuất
- Các loại muối: K2HPO4, KH2PO4, KI, MgSO4. 7H2O, KNO3, NaCl,
FeSO4. 7H2O, (NH4)2SO4, CaCO3, MnCl2, Na2CO3, ZnCl2, ZnSO4.... nhập từ
Trung Quốc, Anh sản xuất
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-25-
-26-
- Các loại cao: Cao thịt, cao nấm men, cao malt, peptone... của hãng
Trypton - 5, cao nấm men - 3; thạch - 18; H2O - 1lít; pH 7 - 7,2.
* Môi trường ISP -2 (g/l)
Merck (Đức).
- Các loại hóa chất khác: thạch, tinh bột tan, casein, CMC (Carboxyl
Methyl Cellulose)... của Nhật, Trung Quốc, Việt Nam sản xuất.
- Các dung môi: etanol, iso-propanol, metanol, aceton.. của Trung Quốc.
2.1.2.2. Dụng cụ và thiết bị
Cao nấm men - 3; Cao malt - 10; Dextrose - 4; Thạch - 20; Nước cất - 1lit;
pH 7 - 7,2.
* Môi trường ISP - 3 (g/l)
Bột kiều mạch - 20; Muối A - 1ml; Thạch - 20; Nước cất - 1lit; pH - 7,2.
- KHVQH Olympus (Nhật)
- Tủ ấm, tủ sấy Memmert (Đức)
* Môi trường ISP - 4 (g/l)
- KHVĐT Joel (Nhật)
- Cân phân tích, cân kỹ thuật
Tinh bột tan - 10; K2HPO4 - 1,0; MgSO4. 7H2O - 1,0; NaCl - 1,0; (NH4)2SO4 -
- Máy lắc (Hàn Quốc)
- Nồi khử trùng (Đài Loan)
2; CaCO3 - 2; dung dịch khoáng - 1ml; thạch - 18g; H2O - 1lít; pH 7 - 7,2.
- Box cấy vô trùng Nuaire (Mỹ)
- Máy đo pH 151 Martini
* Môi trường ISP - 5 (g/l)
- Máy ly tâm Hettich (Đức)
- Máy cất nước Hamilton.
Asparagin - 1; Glixerin - 10; K2HPO4 - 1; Muối A - 1ml; Thạch - 20; Nước
- Các dụng cụ thủy tinh của Trung Quốc, Đức, Việt Nam...
cất - 1lit; pH 7,0 - 7,4.
2.1.2.3. Các công thức môi trường
* Môi trường ISP - 6 (g/l)
Môi trường phân lập và giữ giống nấm
Peptone - 10; cao nấm men - 1; xitrat sắt - 0,5; thạch - 18; H2O - 1lít; pH 7 - 7,2.
*Môi trường CZ (Czapek - Dox - Agar) (g/l)
* Môi trường ISP - 7 (g/l)
NaNO3 - 2; KH2PO4 - 1; MgSO4. 7H2O - 0,5; KCl - 0,5; FeSO4 - 0,01;
Glycerol - 15; L - tyrosine - 0,5; L - asparagine - 1; FeSO4.7H2O - 0,01; K2 HPO4 -
Thạch - 20; H2O - 1lít.
0,5; MgSO4. 7H2O - 0,5; Nacl - 0,5; Muối A - 1ml; Thạch - 20; Nước cất -
*Môi trường khoai tây (PDA - Potato Dextrose Agar) (g/l)
1lit; pH 7,2 - 7,4.
Khoai tây miếng - 200; Thạch - 18; đường - 20, H2O 1lít; pH 7 - 1,4.
* Môi trường ISP - 9 (g/l)
Môi trường phân lập, giữ giống và nghiên cứu xạ khuẩn
(NH4)2SO4 - 2,64; KH2PO4 - 2,38; K2HPO4 - 5,65; MgSO4 - 1; dung dịch
* Môi trường Gause - I (g/l)
muối B - 1ml; nguồn cacbon - 10; thạch - 20; H2O - 1lít; pH 6,8 - 7.
Tinh bột tan - 20; K2HPO4 - 0,5; MgSO4. 7H2O - 0,5; NaCl - 0,5; (NH4)2SO4 2; KNO3 - 0,5; FeSO4 - 0,01; Thạch - 18 g; H2O - 1lit; pH 7 - 7,4.
* Môi trường Gause - II (g/l)
- Dung dịch muối A (%): FeSO4 - 0,1; ZnSO4 - 0,15; MnCl2 - 0,1;
Nước cất - 100ml.
- Dung dịch muối B (%): CuSO 4 - 0,64; FeSO4 - 0,11; MgCl2 - 0,79;
Nước chiết thịt - 30ml; pepton - 5; NaCl - 5; glucoza - 10; Thạch - 18g; H2O -
nước cất - 100ml.
1lít; pH 7 - 7,4.
* Môi trường 79 (g/l)
* Môi trường ISP - 1 (g/l)
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-27-
-28-
Glucoza -10; peptone -10; cazein thủy phân - 2; cao nấm men - 2; NaCl - 6,
CZ. Thu nhận giống thuần khiết trong ống thạch nghiêng và bảo quản trong tủ
K2HPO4 - 0,2; thạch - 18; H2O - 1lít; pH 7 - 7,4.
lạnh ở 40C [14].
* Môi trường A4 - H (g/l)
2.2.2. Phân lập và tuyển chọn xạ khuẩn
Glucoza - 15; bột đậu tương - 15; NaCl - 5; CaCO3 - 1; H2O - 1lít; pH 7.
2.2.2.1. Phân lập xạ khuẩn theo Vinogradski
* Môi trường A - 4 (g/l)
Cân 1g đất cho vào bình nón 50 ml chứa 9ml nước cất vô trùng, lắc trên
Glucoza - 10; bột đậu tương - 10; NaCl - 5; CaCO3 - 1; H2O - 1lít; pH 7.
máy lắc 30 phút. Dùng pipet vô trùng hút 0,5 ml dịch đất sang ống nghiệm có
* Môi trường Tinh bột (g/l)
chứa 4,5 ml nước vô trùng và tiếp tục pha loãng đến 10-2, 10-3...10-6. Từ mỗi
Tinh bột - 20; K2HPO4 - 0,5; MgSO4 - 0,5; KNO3 - 1; NaCl - 0,5; FeSO4 -
nồng độ pha loãng ở các nồng độ 10-3 đến 10-6, nhỏ 0,1ml sang đĩa Petri chứa
0,01; Agar - 30,0; Nước - 1 lít; pH 7,2 - 7,4.
môi trường Gause - I. Dùng que gạt vô trùng chang đều, sau đó nuôi ở nhiệt
* Môi trường Czapek Glycerin (g/l)
độ phòng từ 4 - 7 ngày. Trên mỗi mẫu đất, khuẩn lạc của xạ khuẩn được cấy 3
Glycerin - 30,0; NaNO3 - 2,0; K2HPO4 - 1.0; MgSO4 - 0,5; KCl - 0,5; FeSO4 -
pha sang đĩa Petri chứa môi trường Gause - I để làm sạch. Sau đó nuôi ở nhiệt
0,01; Agar - 20,0; Nước - 1 lít.
độ phòng 4 - 7 ngày, từ các khuẩn lạc được làm sạch cấy truyền sang ống
* Môi trường Czapek Gluco (g/l)
nghiệm chứa môi trường thạch nghiêng Gause - I, tiếp tục nuôi ở điều kiện
Gluco - 30,0; NaNO3 - 2,0; K2HPO4 - 1.0; MgSO4 - 0,5; KCl - 0,5; FeSO4 -
trên trong 10 - 14 ngày [12].
0,01; Agar - 20,0; Nước - 1 lít.
Theo ISP màu sắc khuẩn ty khí sinh của các chủng xạ khuẩn được chia
2.2 Phƣơng pháp nghiên cứu
thành 8 nhóm màu: White (W) nhóm trắng, Gray (Gy) nhóm xám, Red (R)
2.2.1. Phƣơng pháp phân lập nấm gây bệnh từ các mẫu chè
nhóm đỏ, Yellow (Y) nhóm vàng, Green (Gn) nhóm xanh, Blue (B) nhóm
Chọn các mẫu chè có triệu chứng điển hình, mới. Rửa mẫu bệnh sạch
xanh da trời, Violet (V) nhóm tím, và nhóm màu không xác định (X)
đất cát dưới vòi nước,cắt chọn mảnh mô bệnh thích hợp. Khử trùng bề mặt
[16],[19], [42].
các mảnh mô trên bằng cồn (etanol 70%) trong vòng 3 phút. Rửa lại bằng
2.2.2.2. Xác định hoạt tính kháng sinh
nước cất vô trùng, thấm khô mảnh mô bằng giấy thấm vô trùng. Dùng dao mổ
Phương pháp thỏi thạch (dùng để sơ tuyển Xạ khuẩn)
vô trùng cắt các mảnh mô trên thành các mảnh nhỏ 1 - 3mm (chứa cả phần
Xạ khuẩn được nuôi cấy trên môi trường ISP - 4 hoặc Gause - I trong
mô bệnh và mô khỏe). Dùng panh vô trùng đặt các mảnh mô nhỏ trên vào môi
đĩa petri sau 7 ngày dùng khoan nút chai khoan các thỏi thạch đặt vào đĩa
trường Czapek trên đĩa petri. Ghi chú cẩn thận bằng bút viết kính: ngày, cây,
petri đã cấy VSV kiểm định. Sau đó để vào tủ lạnh 4 - 5h cho CKS khuếch
0
bệnh.. Để đĩa môi trường đã đặt mẫu trong tủ ấm 30 C. Theo dõi sự phát triển
tán vào môi trường thạch sau đó để vào tủ ấm. VSV kiểm định nuôi ở 28 -
của sợi nấm mọc ra từ mô bệnh. Khi nấm đã phát triển từ mô bệnh ra môi
300C, đọc kết quả sau vài ngày [7].
trường, lấy phần đỉnh sợi nấm chuyển sang môi trường thích hợp: PDA hoặc
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-29-
-30-
HTKS được xác định dựa vào kích thước vòng vô khuẩn (D - d, mm),
2.2.4. Nghiên cứu các đặc điểm sinh học và phân loại xạ khuẩn
D là kích thước vòng vô khuẩn và d là đường kính thỏi thạch.
2.2.4.1. Đặc điểm hình thái
Phương pháp đục lỗ (Xác định hoạt tính kháng sinh trong dịch thể)
Quan sát màu sắc của hệ sợi khí sinh
Dùng khoan nút chai đục các lỗ trên môi trường thạch đã cấy VSV
Dựa theo tài liệu của ISP, Gause và cộng sự (1983), xác định màu sắc
kiểm định trong đĩa petri. Nhỏ vào các lỗ khoan dung dịch cần thử (các bước
của HSKS dựa vào bảng màu của Tresner và Bakus. Căn cứ vào màu sắc
tiếp theo tiến hành như phương pháp thỏi thạch).
HSKS của các chủng mới phân lập để phân thành các nhóm màu theo Gause
Phương pháp khoanh giấy lọc (Xác định hoạt tính kháng sinh trong dung môi)
và cộng sự: White (W) nhóm trắng, Gray (Gy) nhóm xám, Red (R) nhóm đỏ,
Khoanh giấy lọc F8 có đường kính 6mm được tẩm một lượng dịch
0
CKS (1ml/10 khoanh giấy lọc). Sau đó sấy khô ở 40 C, đặt khoanh giấy lọc
đã tẩm CKS vào đĩa petri đã cấy VSV kiểm định (các bước tiếp theo giống
Yellow (Y) nhóm vàng, Green (Gn) nhóm xanh...
Quan sát màu sắc của hệ sợi cơ chất
Màu sắc của HSCC được xác định qua quan sát trực tiếp trên môi
phương pháp thỏi thạch).
trường thạch đĩa hoặc thạch nghiêng và mô tả theo thang màu chuẩn của
2.2.2.3. Tuyển chọn các chủng xạ khuẩn sinh chất kháng sinh
Bondarsev (1953), Tresner và cộng sự (1961).
Từ ống thạch nghiêng giống đã hoạt hóa được cấy truyền sang các bình
nón dung tích 250 ml chứa 100 ml môi trường Gause - I và nuôi lắc 220 vòng/
Quan sát cuống sinh bào tử
Xạ khuẩn được nuôi cấy trên môi trường Gause - I có găm lamen
nghiêng 450 trên bề mặt môi trường. Sau 7 - 9 ngày nuôi ở nhiệt độ phòng lấy
phút trong 48 giờ ở nhiệt độ phòng.
Giống phát triển được cấy truyền với tỷ lệ 10% sang bình nón dung tích
ra quan sát hình dạng chuỗi sinh bào tử trên lamen dưới kính hiển vi quang
250 ml chứa 80 ml môi trường Gause - I dịch thể. Quá trình lên men kéo dài
học. Chuỗi sinh bào tử có các dạng thẳng hay hơi lượn sóng ký hiệu là RF
96 giờ ở nhiệt độ phòng trên máy lắc 220 vòng /phút. Sau đó thử HTKS trong
(Rectiflexibiles), hình móc câu hay hình xoắn không hoàn toàn ký hiệu là RA
dịch lọc [7].
(Retinaculiaperti) và xoắn hoàn toàn ký hiệu là S (Spirales) [33], [35], [41].
2.2.3. Bảo quản giống
Quan sát bề mặt bào tử
Các chủng xạ khuẩn đã lựa chọn được cấy trên môi trường thạch
Dùng màng cacbon đặt trực tiếp lên bề mặt khuẩn ty khí sinh có bào tử,
nghiêng Gause - I ở nhiệt độ phòng. Sau 10 - 14 ngày khi xạ khuẩn mọc tốt,
sau đó quan sát và chụp ảnh dưới kính hiển vi điện tử quét. Bào tử có các hình
các ống giống được bảo quản trong tủ lạnh ở 4 - 60C. Sau 2 - 3 tháng cấy
dạng: tròn, ovan, elíp, hình que [33].
truyền lại một lần.
Bề mặt bào tử xạ khuẩn có các dạng: Nhẵn ký hiệu là Sm (Smooth),
Để bảo quản lâu giống được giữ trong ống cát, trong parafin lỏng vô trùng giữ
dạng mụn cóc ký hiệu là Wa (Warty), dạng gai ký hiệu là Sp (Spiny) và dạng
lạnh sâu trong glycerin hoặc đông khô, bảo quản được 6 tháng đến 2 năm.
tóc ký hiệu là Ha (Hairy).
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-31-
-32-
2.2.4.2. Đặc điểm nuôi cấy
Hoạt tính enzym được xác định bằng giá trị D - d (mm). Sau khi nhuộm màu
Màu sắc khuẩn ty khí sinh, khuẩn ty cơ chất và sắc tố tan
đỏ Công gô (cơ chất CMC), axit tricloaxetic (cơ chất casein) và thuốc thử
Xạ khuẩn được nuôi cấy trên môi trường: Gause - I, Gause - II, ISP - 1, ISP
Lugol (cơ chất tinh bột). Vùng cơ chất bị phân giải không bắt màu ở xung
- 2, ISP - 3, ISP - 4, ISP - 5, ISP - 6, ISP - 7 ở nhiệt độ phòng. Sau 7, 14, 21 ngày
quanh lỗ thạch.
lấy ra quan sát màu sắc KTKS, KTCC và sắc tố tiết ra môi trường [33], [37].
Khả năng chịu muối
Sự hình thành sắc tố melanin
Cấy xạ khuẩn trên môi trường thạch nghiêng ISP - 1 có bổ sung thêm
Xạ khuẩn được nuôi cấy trên môi trường ISP - 6 ở nhiệt độ phòng. Bắt
NaCl với các nồng độ 0,5; 3; 7; 9; 11; 12 (%). Sau 7 - 10 ngày lấy ra quan sát
đầu quan sát màu của môi trường sau 24 giờ cho đến ngày thứ 14. Nếu sinh
sự sinh trưởng.
melanin, màu của môi trường sẽ chuyển từ màu vàng nhạt sang màu nâu đậm
Khả năng sử dụng các nguồn cacbon
cho đến màu đen [33].
Xạ khuẩn được nuôi cấy trên môi trường ISP - 9 có bổ sung 1% các
2.2.4.3. Đặc điểm sinh lý - sinh hóa
nguồn đường: Glucoza, maltoza, fructoza, lactoza, sacaroza....
Khả năng sinh enzym ngoại bào
Cách làm: Cân 1g đường, thanh trùng bằng đèn UV rồi bổ sung vào 100ml
- Chiết dịch enzym
môi trường ISP - 9 còn nóng. Lắc cho tan đường rồi đổ vào đĩa Petri và nuôi
Thu enzym từ môi trường lỏng: xạ khuẩn sau khi được nuôi trên môi trường
cấy xạ khuẩn ở nhiệt độ 28 -300C, sau 14 ngày quan sát sự sinh trưởng của
Gause II dịch thể sẽ được lọc bỏ sinh khối hoặc ly tâm ở 5000 vòng/ phút
các chủng và so sánh với đối chứng [33].
trong 15 phút, chiết dịch trong thì thu được enzym thô.
Trong đó môi trường có glucoza được coi là đối chứng dương (+) và môi
- Xác định hoạt tính các enzym ngoại bào bằng phương pháp khuếch tán trên
trường không có đường được coi là đối chứng âm (-).
- Nếu xạ khuẩn sinh trưởng mạnh bằng hoặc kém hơn đối chứng dương
thạch với một trong các nguồn cơ chất sau:
- Tinh bột tan (xác định hoạt tính amylaza)
một ít: có khả năng sử dụng loại đường đó. ký hiệu là (+).
- Cazein (xác định hoạt tính proteaza)
- Nếu xạ khuẩn sinh trưởng mạnh hơn đối chứng dương, ký hiệu là (++).
- CMC (xác định hoạt tính endoglucanaza).
- Nếu xạ khuẩn sinh trưởng bằng đối chứng âm hoặc không mọc: không
Chuẩn bị môi trường cơ chất - thạch gồm: 20g thạch + 2 - 10g cơ chất, pha
môi trường trong 1000 ml nước. Thanh trùng ở 1 atm trong 30 phút. Đổ môi
có khả năng sử dụng loại đường đó, ký hiệu là (-).
- Nếu xạ khuẩn sinh trưởng tốt hơn đối chứng âm một ít nhưng kém
trường vào các đĩa Petri sao cho bề dày lớp thạch khoảng 3 mm. Dùng khoan
hơn đối chứng dương nhiều, ký hiệu là (±).
nút chai đục lỗ (d = 10 mm) trên lớp thạch cách nhau 40 mm. Nhỏ 0,2 ml
2.2.5. Lên men tạo kháng sinh
0
dung dịch enzym cần thử và 0,2 ml nước làm đối chứng, để ở tủ lạnh 4 C
0
khoảng 4 giờ, sau đó đặt vào tủ ấm 30 C trong 24 giờ [23].
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
2.2.5.1. Lựa chọn môi trường lên men thích hợp
Xạ khuẩn được lên men trên các môi trường cơ bản (theo Porter) là:
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-33-
-34-
A - 4, A - 4H, A - 9, ISP - 4, Gause - I và Gause - II. Sau 96 giờ nuôi cấy trên
Hòa tan cặn tế bào trong 0,8 ml TE 25S, lắc đều bằng vontex. Bổ sung
máy lắc 220 vòng/ phút ở nhiệt độ phòng. Xác định HTKS trong dịch lên men
40 µl lysozym, ủ ở 370C trong 90 phút (nồng độ cuối cùng của lysozym là
(phương pháp đục lỗ) và sinh khối (phương pháp khoanh giấy lọc) để chọn ra
2mg/ ml).
môi trường cơ bản phù hợp cho những nghiên cứu tiếp theo [34].
2.2.5.2. Ảnh hưởng của nguồn cacbon
Bổ sung 10 µl protease K, mix đều, thêm 60 µl 10% SDS, đảo nhẹ, ủ
1giờ ở nhiệt độ 550C (nồng độ cuối cùng của protease K là 0,18mg/ml, SDS
Bổ sung nguồn cacbon (%): Tinh bột tan 1 và 2; glucoza - 1,5; lactoza 1,5; sacaroza - 1,5; rỉ đường - 1,5; vào hỗn hợp dung dịch muối (dung dịch
là 0,5%).
Bổ sung 150 µl NaCl 5M, mix đều. Sau đó bổ sung 130 µl CTAB, mix
đều, ủ 10 phút ở 550C.
muối A) đã bổ sung 0,2 % (NH4)2SO4.
Bổ sung giống và lên men trên máy lắc tròn với tốc độ 220 vòng/ phút.
Đặt ở nhiệt độ phòng 5 phút, chia đều ra 2 ống eppendorf mới. Sau đó bổ
Sau 96 giờ lên men xác định HTKS trong dịch lên men bằng phương pháp
sung vào mỗi ống 700 µl chlorofom/ isoamyl alcohol, mix đều 15 phút. Ly
đục lỗ thạch.
tâm 9000 vòng/phút trong 20 phút để tách pha.
2.2.5.3. Ảnh hưởng của nguồn Nitơ
Chuyển dịch pha trên sang các eppendorf mới và bổ sung 0,6V
Bổ sung nguồn Nitơ (%): Cao nấm men, bột đậu tương, (NH4)2SO4 và
isopropanol, đảo nhẹ. Đặt trong tủ - 200C trong 30 - 40 phút. Ly tâm 9000
KNO3 vào hỗn hợp dung dịch muối đã bổ sung thêm 1,5% glucoza. Sau đó bổ
vòng/phút, rửa tủa bằng etanol 70%. Hòa tan DNA trong 100 µl TE.
sung giống rồi lên men và thử HTKS bằng phương pháp đục lỗ.
2.2.6.2. Khuếch đại gen rRNA - 16S bằng phản ứng PCR
2.2.6. Các phƣơng pháp sinh học phân tử trong phân lập gen 16S - rRNA
Nguyên tắc:
2.2.6.1. Tách chiết DNA của xạ khuẩn bằng đệm CTAB
PCR là phản ứng trùng hợp, cho phép khuếch đại một đoạn DNA cụ
Nguyên tắc:
thể lên hàng triệu lần nhờ sự xúc tác của DNA polymerase chịu nhiệt. Enzym
Phá vỡ thành tế bào của xạ khuẩn nhờ lyzozym. Loại bỏ protein khỏi
này có khả năng hoạt động ở nhiệt độ cao. Sự hoạt động của enzym được
DNA nhờ các enzym protease K. Phân tách các thành phần của tế bào sau khi
kiểm soát của một chu kỳ nhiệt xác định. Đoạn DNA được tổng hợp được
phá vỡ thành hai pha nhờ dung dịch đệm chlorofom: isoamyl alcohol (24:1):
giới hạn về mặt kích thước bởi một cặp mồi đặc hiệu.
pha trên chứa cặn tế bào, pha dưới chứa axit nucleic. Sau cùng, DNA được
Cặp mồi được sử dụng trong nghiên cứu có trình tự là:
tủa bằng ethanol tuyệt đối (đã được làm lạnh - 22), được làm khô và hòa tan
Trình tự mồi: Mồi xuôi 27
trong đệm TE [39].
Mồi ngược 1525
Tiến hành:
5' - agagtttgatcctggctcag - 3'
'
'
5 - aaaggaggtgatccagcc - 3
27- 47
1525 -1507
Tiến hành:
Lấy 1,5ml dịch nuôi cấy tế bào đem ly tâm tốc độ 3000 vòng/ phút trong
30 phút để thu cặn tế bào.
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-35-
-36-
Thành phần phản ứng
H2O
Buffer (10X)
dNTP (2,5mM)
Primer 1 (10pml)
- Nhuộm bản gel: Bản gel sau điện di được ngâm vào dung dịch thuốc
Chu kỳ nhiệt
3 phút
nhuộm EtBr nồng độ 2 g/ml trong khoảng 10 phút, lắc nhẹ trên máy lắc, sau
2,5µl 94 C
1 phút
đó soi gel trên đèn UV và chụp ảnh bằng máy chụp gel của hãng Bio - Rad.
2µl 640C
1 phút
2.2.7. Phương pháp xử lý số liệu
17,1µl 940C
0
0
1µl 72 C
Primer 2 (10pml)
1µl
ADN khuôn
1µl
Enzyme Taq
0,4µl
Tổng
25µl
0
4C
1 phút 30 giây
∞
Kết quả nghiên cứu được chúng tôi xử lý theo phương pháp thống kê
sinh học trên phần mềm Excel.
2.2.5.3. Phương pháp điện di trên gel agarose
Phương pháp điện di trên gel agrose được sử dụng để kiểm tra DNA
plasmid, kiểm tra các phân đoạn DNA được nhân bằng kỹ thuật PCR và kiểm
tra kết quả cắt giới hạn. Phương pháp này được chia làm một số bước như
sau:
- Chuẩn bị gel agarose: cân một lượng agarose tương ứng (tùy theo nồng
độ gel yêu cầu) vào trong dung dịch 100ml TAE 1X. Đun sôi bằng lò vi sóng,
để nguội xuống khoảng 500C rồi đổ dung dịch vào bản gel đã cài sẵn lược.
Sau khoảng 30 phút, đặt bản gel vào bể điện di và đổ dung dịch điện di TAE
ngập bản gel.
- Tra mẫu: lấy 1 - 2 g DNA pha loãng trong 16 l đệm TE, sau đó bổ
sung 4 l dye mầu. Một lượng DNA maker tương ứng cũng được tra vào bản
gel trước khi điện di.
- Điện di: Điện di tại hiệu điện thế không đổi 100V trong khoảng 20 - 30
phút. Quan sát sự di động của DNA từ cực âm sang cực dương thông qua dye
mầu.
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-37-
-38-
Chƣơng 3
KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
3.1. Phân lập và thuần khiết các chủng nấm gây bệnh trên chè
Từ các mẫu chè bị bệnh thu thập ở các khu vực khác nhau của tỉnh Thái
Nguyên, chúng tôi đã phân lập và thuần khiết được 3 chủng nấm được ký hiệu
Chủng CT - 1A
là CT - 1A, CT - 2E và CT - 5X.
Chủng CT - 2E
Các chủng nấm phân lập được đều có đặc điểm chung là: các sợi nấm
đều không có màu sắc, sợi nấm có vách ngăn (hình 3.1). Mỗi chủng nấm được
phân lập từ một mẫu chè có biểu hiện bệnh khác nhau. Kết quả được trình
bày trên bảng 3.1.
Bảng 3.1. Đặc điểm một số mẫu chè làm nguồn phân lập các chủng nấm
Ký hiệu chủng
Nguồn phân
nấm
lập
CT - 1A
CT - 2E
CT - 5X
Lá chè non
Lá chè non
Lá chè non
Biểu hiện bệnh
Chủng CT - 5X
Trên bề mặt lá và mép lá có nhiều
Hình 3.1. Ba chủng nấm phân lập từ các mẫu chè bị bệnh
đốm nâu
3.2. Phân lập và tuyển chọn xạ khuẩn
Vết bệnh có màu nâu sẫm, lúc đầu
3.2.1. Hoạt tính kháng nấm của các chủng xạ khuẩn
chỉ có chấm nhỏ màu đen, sau đó lan
Từ các mẫu đất lấy ở độ sâu 5 - 10 cm tại các địa điểm khác nhau thuộc
ra khắp lá.
tỉnh Thái Nguyên, chúng tôi đã phân lập và thuần khiết được 80 chủng xạ
Các lá bị xoăn, trên mặt lá có thể bị
khuẩn thuộc chi Streptomyces. Sau khi thử HTKS theo phương pháp khuếch
nhăn.
tán trên thạch với 3 chủng nấm CT - 1A, CT - 2E, CT - 5X, chúng tôi đã
tuyển chọn sơ bộ được 30 chủng trong tổng số 80 chủng xạ khuẩn có hoạt tính
Sau khi được tinh sạch, 3 chủng nấm trên được giữ trong ống thạch
kháng nấm ở các mức độ khác nhau, chiếm tỷ lệ 37,5%. So sánh với tỷ lệ
nghiêng trên môi trường Czapek và được sử dụng làm VSV kiểm định để
chủng xạ khuẩn kháng nấm gây bệnh đạo ôn đã công bố trước đây cùa Lê
tuyển chọn xạ khuẩn sau này.
Gia Hy và cộng sự [18], tỷ lệ chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng nấm gây
bệnh trên chè của chúng tôi có phần cao hơn.
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
-39-
-40-
Bảng 3.2. Xạ khuẩn có hoạt tính kháng nấm theo nhóm màu
Nhóm màu
xạ khuẩn
Kết quả trên bảng 3.2 cho thấy: số lượng chủng có hoạt tính nhiều nhất
Các chủng có
Tỷ lệ chủng có
là nhóm trắng chiếm 36,7%, sau đó là nhóm xám - 26,7%, nhóm xanh -
HTKN
HTKN so với tổng
25,3%, nhóm hồng - 6,7% và ít nhất là các nhóm nâu và lục đều chiếm 3,3%.
Số lượng Tỷ lệ(%)
số (%)
Kết quả này của chúng tôi cũng phù hợp với những nghiên cứu của một số tác
giả trước đây [14],[18].
Trắng (Allbus)
11
36,7
13,7
Xám (Griseus)
8
26,7
10,0
Xanh (Azeureus)
7
23,3
8,6
xạ khuẩn với 3 chủng nấm gây bệnh trên chè có sự khác nhau (bảng 3.3).
Hồng (Roseus)
2
6,7
2,6
Bảng 3. 3. Tính đối kháng của xạ khuẩn với 3 chủng nấm gây bệnh trên chè
Nâu (Chromogenes)
1
3,3
1,3
Lục (Viridis)
1
3,3
1,3
Tổng cộng
30
100
37,5
Tỷ lệ các chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng nấm phân chia theo nhóm màu
của Shirling và Gottlieb [37]. Kết quả được thể hiện trên bảng 3.2 và hình 3.2.
Đồng thời chúng tôi cũng nhận thấy khả năng đối kháng của các chủng
3 chủng nấm gây bệnh chè
Chủng XK
Kháng cả
có HTKN
CT - 1A
CT - 2E
CT - 5X
Số lượng
9
16
13
4
Tỷ lệ (%)
30
53
43
13,3
3 chủng
Trong tổng số 30 chủng có hoạt tính kháng nấm, số chủng kháng nấm
CT - 2E là cao nhất, có 16 chủng (chiếm 53% ), tiếp theo là số chủng kháng
nấm CT - 5X, có 13 chủng (chiếm 43%) và ít nhất là chủng kháng nấm CT - 1A
có 9 chủng (chiếm 30%).
Hình 3. 2. Tỷ lệ các chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng nấm theo nhóm màu
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
Hình 3.3. Tỷ lệ các chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng nấm
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên