 


 !"#

TIN SINH HỌC
Chương II
TÌM KIẾM DỮ LIỆU SINH HỌC
 
CHƯƠNG II. TÌM KIẾM DỮ LIỆU SINH HỌC
1. CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC VÀ CÁC NGÂN HÀNG DLSH
2. CÁC CÔNG CỤ TÌM KIẾM, PHÂN TÍCH CÁC CSDL
3. THỰC HÀNH TÌM KIẾM CÁC DLSH
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$

$&12345617135859:;<=>6
7?@?A8@<=>>B>9CDE<F@:;G6
<H<=65FB> I1JF @ :=G6<H
K:>B>9LMCD

$9:NL%O1PQR5%6<4S2 IJ
9NT<G MB>UC345615GR
5$V'@W)V@VX<>SI3456E<FY
L%O5%6<42EV7E<F>>V>K8
I. Cơ sở dữ liệu sinh học và các ngân hàng dữ liệu sinh học:
""!9Z696;&1234561
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$

$9:;3456?@<FBNR65<=

65F<=>Q> 

CF[\]QF % I%19@<
L\ 6J19T5 I<=65FB>?^>>
B><FHL;6\L91JV_9N^9
K9>L;6\]= L%O<= >Z6>C 456;
<=65F<?<=>><<F54
:12 `LICD
I. Cơ sở dữ liệu sinh học và các ngân hàng dữ liệu sinh học:
""!9Z696;&1234561
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
I. Cơ sở dữ liệu sinh học và các ngân hàng dữ liệu sinh học:
""!9Z696;&1234561

J?L\51J5%O@a@<=1PQRB>
965F@<S65F<CD? A?:
;?%bc<H d\>1ef F=g\
^<LJ%O1hgECSJ2LC6g<>9
:NY5Z6>LRGL;`6=g$B>9
eg

J<FL\51J5%O<=1PQRB>>><
"CD<F$9:N[S>i LT
><YB><F@<T\ ^<RS@ :@&Z6>
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
I. Cơ sở dữ liệu sinh học và các ngân hàng dữ liệu sinh học:
""!9Z696;&1234561


Genomic:Ge43456;:3<6N;B> I
RS1hGL

Proteomic:Ge91ef B>F7<F8B> IR
S :^&Z6>B> I1hL\< I>
LM15TGLEM j>\]\L\5kO
1ef 3 B>Ge9 ?A<RS1hM
bL] `67`5%Rhl<F8
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
>N\9&123456C345615
B>R

$V'7>>5$F<Fm<VF5N'm< >8

W)V7W6<F>)5F65><V5N>S<><N8

VX7?>>V>KmX>>8

EV7E<F>>V>K8

1.2. Các cơ sở dữ liệu sinh học:
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.2.1. NCBI (>>5$F<Fm<VF5N'm< >)&
123456B>)n7oopppS5 o8<$V'\
9 q

PubMed:`>a\ PB>&"#rrrrrrKRZ6e
`6<5s1N7oo

pppS5 o6S F3o8

Booksheft:= KR 4:&Se^9BL;
`6 

PubMed central:5hO4MTK>11J
KROJWt<Ft@E6S)F3F<>5u<6Nh
3K:MR&"vrMTK>

 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$

 OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man8&
"#rrrL q@w)')L%O36N<=S2R1s<?
)!61KI17MX1K18@Le"
JS3<6N;5qL%O63>F

 OMIA 7w5F)F3F5>'F<>F? >518 5 I&12
3456B>9F@9F<J5M3<6N;9T<M
B>95LIh

Journals: = KR 9&123456MTuKR
J
1.2.1. NCBI (>>5$F<Fm<VF5N'm< >)
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.2.1. NCBI (>>5$F<Fm<VF5N'm< >)
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.2.1. NCBI (>>5$F<Fm<VF5N'm< >)

 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.2.1. NCBI (>>5$F<Fm<VF5N'm< >)
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.2.2. W)V7W6<F>)5F65><V5N>S<><N8
W)VG66N<=65F3FTB>C6
x66iTB>9<=?A?5L%OL%>5
<Rl9`6@939`6F9
19R`3qW)VL%O=< I1O9
Z6JRFV>K7)n8&123456?B>hVe
7VX8
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.2.1. W)V7W6<F>)5F65><V5N>S<><N8
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.2.1. W)V7W6<F>)5F65><V5N>S<><N8
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.2.3. VX7?>>V>KmX>>8
C3456?B>hVe5C3456;
9<=65F3F36NG2C6y$&12345
z
6N
<>Lk934566hL%O&123456W)V
FV>K$9&123456Na6%JGL%O
5{'@&123456<=65F3FZ6JR|VX6
h34566BNR65l9`6hVe@
%G}Gh3456l9`6

<SGK~9Z6J>K9••€3456'l9
`6hVeL%OD:Z6>VX
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.2.3. VX7?>>V>KmX>>8
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.2.3. VX7?>>V>KmX>>8
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
PDB là kho lưu trữ duy nhất trên toàn thế giới, thông tin về các
cấu trúc 3D của các phân tử sinh học lớn, bao gồm cả protein và
axit nucleic. Đây là những phân tử của sự sống được tìm thấy trong
tất cả các sinh vật bao gồm vi khuẩn, nấm men, thực vật, ruồi, động
vật khác, và con người. Hiểu biết về hình dạng của một phân tử
giúp chúng ta hiểu nó hoạt động như thế nào. Kiến thức này có thể
được sử dụng để giúp suy ra vai trò của một cấu trúc trong sức khỏe
con người và bệnh tật, và trong thuốc phát triển. PDB miễn phí cho
người sử dụng. Các kho lưu trữ PDB được cập nhật thứ tư mỗi tuần.
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
"•‚EV7E<F>>V>K8
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
"•‚EV7E<F>>V>K8
ooppp<1S<o3So Fo F3
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.3. Sử dụng trình tự DNA và protein:
1.3.1. Cơ sở dữ liệu về nucleotit(nucleotide databases):


GenBank :hOGe9<=65F>Q> 
\

GenBank75 IaB>'F<>>565FFZ6F1F
3>>S>1F55>S<>S>i 2V@W)V@$V'85&12
3456<=3<6N;B>'$ƒMH>\]
QF Se"FB>>>< NF1F<F1F>=
FV>KLd6GLaNLB$`1>6•9@"Se
63>FL%OL%><>
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.3.1. Cơ sở dữ liệu về nucleotit(nucleotide databases):
oopppS5 oFS>Ko
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.3.1. Cơ sở dữ liệu về nucleotit(nucleotide databases):
oopppFS>6KoF S5o
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.3.1. Cơ sở dữ liệu về nucleotit(nucleotide databases):
ooppp33S„>„o
 
$%&''()!'*)$+,-'./'0$
1.3.2. Cơ sở dữ liệu protein:
1.3. Sử dụng trình tự DNA và protein:
ooppp6<<o